员工主动辞职后提起劳动仲裁，用人单位应当积极应对，以下是从多个角度给出的详细建议：
明确仲裁事项与请求：
- 用人单位在收到劳动仲裁委员会的通知后，首要任务是仔细研读相关文件，全面了解员工提出的仲裁请求及其所依据的事实和理由。这有助于用人单位准确把握争议焦点，为后续的应对策略制定提供基础。
全面收集与整理证据：
- 证据是劳动仲裁中的核心要素。用人单位应围绕员工的仲裁请求，积极收集并整理对自己有利的证据材料。这些证据应包括劳动合同、工资支付记录、考勤记录、规章制度及告知记录、离职文件等。例如，如果员工主张未支付加班工资，用人单位应提供考勤记录和工资支付记录来证明已按时足额支付。
- 特别提醒：确保所有证据的真实性、合法性和关联性，避免使用虚假或不实的证据，否则可能面临法律责任。
撰写并提交答辩书：
- 根据劳动仲裁委员会的要求，用人单位需在规定时间内提交书面答辩书。答辩书应针对员工的仲裁请求和理由进行逐一回应，阐明用人单位的观点和事实依据。内容需清晰、逻辑严谨，并引用相关法律法规来支持自己的观点。例如，如果员工主张违法解除劳动合同，用人单位可以在答辩书中说明解除劳动合同的合法依据和程序。
参加仲裁庭审：
- 准时出庭：按照通知的时间和地点准时参加庭审，避免因无正当理由拒不到庭而被视为放弃答辩和举证权利。
- 遵守纪律：在庭审中尊重仲裁员和其他参与人，遵守庭审秩序。
- 陈述观点与举证：清晰、准确地陈述用人单位的观点和理由，出示收集的证据，并对员工提供的证据进行质证。例如，对于员工提供的证人证言，用人单位可以询问证人的身份、与案件的关系以及证言的真实性等。
- 参与辩论与调解：在辩论环节积极发言，同时考虑仲裁委员会组织的调解。如果调解方案合理，用人单位可以考虑接受以节省时间和成本。
执行裁决或进一步维权：
- 履行裁决：若仲裁裁决支持员工的部分或全部请求，且用人单位无异议，应在规定时间内履行裁决义务。例如，支付拖欠的工资或经济补偿金等。
- 提起诉讼：如对仲裁裁决不服，用人单位可在规定期限内向人民法院提起诉讼。在决定是否提起诉讼前，应仔细评估诉讼的成本、风险及可能带来的法律后果。例如，如果仲裁裁决的金额较小，而诉讼成本较高，用人单位可能需要权衡利弊后再做决定。
加强内部管理与预防：
- 用人单位应加强内部管理和制度建设，规范劳动用工行为，以预防劳动争议的发生。通过定期培训、完善规章制度、建立有效的沟通机制等措施，营造和谐稳定的劳动关系环境。例如，定期组织员工学习劳动法律法规和用人单位的规章制度，提高员工的法律意识和合规意识。
可能面临的法律后果及应对：
- 如果用人单位未能积极应对劳动仲裁，可能导致仲裁裁决对用人单位不利，如支付高额的经济补偿金或赔偿金等。
- 如果用人单位在仲裁过程中提供虚假证据或隐瞒重要事实，可能面临法律责任，如被罚款、拘留等。
总结与建议：
面对员工的劳动仲裁申请，用人单位应保持冷静、积极应对。通过明确仲裁事项与请求、全面收集与整理证据、撰写并提交答辩书、参加仲裁庭审、执行裁决或进一步维权以及加强内部管理与预防等措施，用人单位可以有效地维护自己的合法权益。如果你在处理过程中遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供针对性的法律建议。