在劳动仲裁中，劳动者申请补缴社保时，一般不能直接申请查公司账本，但可通过合法途径间接获取相关财务信息作为证据。具体分析如下：

1. 劳动仲裁的权限范围
   劳动仲裁机构主要审理劳动争议案件，其调查权限通常限于与劳动关系直接相关的证据（如劳动合同、工资记录、考勤表等）。社保补缴争议的核心是用人单位是否依法履行缴费义务，仲裁庭一般会要求用人单位提供社保缴费记录、工资总额等直接证据，而非直接审查公司账本。

2. 劳动者获取公司财务信息的合法途径

   • 申请仲裁委调取证据：若劳动者能证明公司账本中的财务数据（如工资总额、奖金发放记录）与社保缴费基数直接相关，且用人单位拒不提供，可依据《劳动争议调解仲裁法》第39条，申请仲裁委责令用人单位提供；若用人单位仍不提供，仲裁委可依据其他证据（如劳动者提供的工资流水、个税申报记录等）推定相关事实。
     
   • 向社保部门投诉：根据《社会保险法》第63条，劳动者可向社保经办机构投诉用人单位未依法缴费，社保部门有权核查用人单位的工资总额、财务报表等，并责令补缴。此时，社保部门的调查结果可作为劳动仲裁或诉讼的证据。
     
   • 诉讼阶段申请法院调查：若案件进入诉讼程序，劳动者可依据《民事诉讼法》第67条，向法院申请调查令，要求公司或第三方机构（如银行、税务部门）提供账本、财务凭证等证据。

3. 直接查公司账本的限制
   公司账本属于商业秘密，受《公司法》《反不正当竞争法》保护。除非涉及重大违法犯罪（如偷逃税、职务侵占），劳动者或仲裁机构无权直接查阅。若劳动者擅自获取或公开公司账本，可能承担侵权责任。

建议行动步骤：

1. 收集个人工资流水、个税申报记录、劳动合同等证据，证明实际收入与社保缴费基数不符；
   
2. 向当地社保经办机构投诉，要求核查用人单位缴费情况；
   
3. 在劳动仲裁中，以社保部门核查结果或用人单位自认的工资数据为证据，主张补缴差额；
   
4. 若用人单位拒不配合，可申请法院调查令，通过合法途径获取财务证据。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。