在解答关于“拒不支付劳动报酬罪立案时，如何证明主体是实际控制人”的问题时，我们需要从多个维度进行深入分析，并结合相关法律法规来给出清晰、详细的解答。

一、实际控制人的定义与特征

首先，我们需要明确“实际控制人”的定义。在拒不支付劳动报酬罪的语境下，实际控制人通常指的是那些虽然可能不是公司的法定代表人或名义上的负责人，但实际上掌控着企业的经营和财务决策，对支付劳动者报酬具有决定权的人员。他们可能通过股权控制、协议安排或其他方式，对企业产生实质性的影响。

二、证明实际控制人身份的关键证据

在立案时，要证明某人是实际控制人，我们需要收集并呈现一系列关键证据。这些证据可能包括但不限于：

1. 股权结构与控制关系：

   • 通过公司章程、股东名册、股权转让协议等文件，证明某人在公司中的股权比例或控制地位。
   • 如果存在多层控股结构，需要逐层梳理，以明确最终的实际控制人。

2. 经营决策与财务控制：

   • 收集公司会议记录、决策文件、财务审批记录等，证明某人在公司经营和财务决策中的核心作用。
   • 特别是要关注那些涉及劳动者报酬支付的关键决策，如工资发放计划、奖金分配方案等。

3. 日常管理与指挥权：

   • 通过员工证言、工作记录、电子邮件等，证明某人在公司日常管理中的实际指挥权。
   • 这包括但不限于对员工的工作安排、考核评价、奖惩措施等。

4. 资金流向与使用：

   • 分析公司银行账户的交易记录，特别是与劳动者报酬支付相关的资金流向。
   • 如果发现资金被转移或隐匿，且与某人的决策或行为有关，这将成为证明其实际控制人身份的重要证据。

三、结合法律法规进行认定

在收集到上述证据后，我们还需要结合相关法律法规进行认定。根据《最高人民法院关于审理拒不支付劳动报酬刑事案件适用法律若干问题的解释》第八条的规定，用工单位的实际控制人实施拒不支付劳动报酬行为，构成犯罪的，也以拒不支付劳动报酬罪追究刑事责任。这一规定为我们认定实际控制人提供了明确的法律依据。

四、立案时的注意事项

在立案时，除了证明某人是实际控制人外，还需要注意以下几点：

1. 确保证据的合法性与真实性：所有收集到的证据必须合法取得，且真实可靠。任何伪造或篡改的证据都将影响案件的审理和判决。

2. 全面考虑其他犯罪主体：虽然我们要证明某人是实际控制人，但也不能忽视其他可能的犯罪主体，如法定代表人、直接负责的主管人员等。在立案时，应全面考虑所有可能的犯罪主体，以确保案件的全面性和准确性。

3. 及时与政府部门沟通：在立案前或立案过程中，应及时与劳动监察部门、公安机关等政府部门沟通，了解案件的相关情况，获取必要的支持和协助。

综上所述，要证明拒不支付劳动报酬罪立案时的主体是实际控制人，我们需要收集并呈现一系列关键证据，包括股权结构与控制关系、经营决策与财务控制、日常管理与指挥权以及资金流向与使用等方面的证据。同时，我们还需要结合相关法律法规进行认定，并注意立案时的相关事项。