运输企业应急预案未签发，这一行为主要违反了《中华人民共和国安全生产法》的相关规定。具体来说，主要涉及以下几个法律条款：

首先，根据《中华人民共和国安全生产法》第二十一条第六款，生产经营单位的主要负责人对本单位安全生产工作负有组织制定并实施本单位的生产安全事故应急救援预案的职责。这意味着，运输企业的主要负责人有责任确保企业制定了相应的应急预案，并且这一预案得到了正式的签发和实施。

其次，若运输企业未按照规定制定生产安全事故应急救援预案，根据《中华人民共和国安全生产法》第九十七条第(六)项，生产经营单位将面临责令限期改正，并处十万元以下的罚款；逾期未改正的，还将被责令停产停业整顿，并处十万元以上二十万元以下的罚款，同时对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员处二万元以上五万元以下的罚款。这一条款明确规定了未制定应急预案的处罚措施。

此外，虽然直接的法律条款并未明确提及“签发”，但“制定并实施”这一表述隐含了预案需要经过正式的程序，包括可能的签发环节，以确保其有效性和权威性。在实际操作中，应急预案的签发是确保其得到正式认可和执行的重要步骤。

案例分析：

以您提供的案例为例，五河县某运输有限公司在未按照规定制定生产安全事故应急救援预案的情况下进行了事故应急演练，这一行为仍然构成了违法。执法人员根据相关法律条款，对该企业进行了罚款处罚。同样，在另一个木材加工企业的案例中，企业未制定应急预案也受到了相应的处罚，并且主要负责人也因未履行相关职责而被罚款。

总结与建议：

因此，运输企业应急预案未签发，实际上违反了《中华人民共和国安全生产法》中关于生产经营单位主要负责人应组织制定并实施生产安全事故应急救援预案的规定。为了避免类似的法律风险和处罚，运输企业应确保制定并正式签发有效的应急预案，并定期组织演练，以提高应对生产安全事故的能力。同时，企业主要负责人也应积极履行相关职责，确保企业的安全生产工作得到有效管理。