结论：公章和法人章不能由同一人保管，虽无法律明确禁止，但从企业内部控制、风险管理和实践案例来看，分开保管是更为合理和安全的做法。
一、法律层面分析
在我国现行法律体系下，并没有明确的法律规定禁止公章和法人章由同一人保管。然而，这并不意味着这种做法没有风险或值得推荐。法律虽未禁止，但企业仍需从风险管理和内部控制的角度出发，审慎考虑印章的保管方式。
二、风险层面考量
舞弊风险：若公章和法人章由同一人保管，该人员可能利用职权之便，绕过正常审批流程，擅自使用印章进行损害公司利益的行为。例如，私自签订合同、提供担保或进行其他未经授权的交易，这些行为都可能给公司带来严重的经济损失和法律风险。
法律纠纷：一旦发生上述违规行为，公司不仅需要承担由此产生的直接经济损失，还可能面临一系列复杂的法律纠纷。例如，因越权盖章而引发的合同纠纷、担保纠纷等，这些纠纷不仅会耗费公司大量的时间和精力，还可能对公司的声誉和信誉造成严重影响。
三、内部控制与制衡原则
有效的内部控制要求对企业关键环节和重要权限进行分离和制衡。分开保管公章和法人章是实现这种制衡的重要措施之一。通过将印章分别交由不同人员保管，可以形成相互制约、相互监督的机制，从而降低因权力集中而引发的风险。这种做法有助于保障公司运营的规范性和安全性，防止内部舞弊和违规行为的发生。
四、实际案例警示
在司法实践中，存在多起因印章管理不善导致的法律纠纷。例如，某公司印章管理员滥用职权，私自签订虚假借款合同并加盖公司印章，最终导致公司承担重大经济损失。这些案例警示我们，必须重视印章管理的规范性，避免类似风险的发生。分开保管公章和法人章是降低这种风险的有效措施之一。
五、管理建议与实践
为了有效加强公司印章管理，降低潜在风险，以下是一些具体的管理建议：
分开保管：将公章和法人章分别交由不同部门或人员保管。例如，公章可由行政部门或综合管理部门指定专人保管，而法人章则可由财务部门或法定代表人指定的专门人员负责。这样可以形成相互制约的机制，降低舞弊风险。
建立严格审批制度：每次使用印章前，均需经过相关负责人的审批，并详细记录用印时间、事由、文件名称等信息。这有助于确保印章使用的合规性和可追溯性，防止未经授权的使用行为。
强化内部监督：通过定期审计、突击检查等方式，加强对印章管理工作的内部监督。这有助于确保各项管理制度得到有效执行，及时发现并纠正存在的问题。
提升员工法律意识：加强对员工的法律知识培训，提高其对印章管理重要性的认识。这有助于增强员工的法律风险意识，防止因疏忽或无知而导致的违规行为。
总结：虽然法律上并未明确禁止公章和法人章由同一人保管，但考虑到风险管理和内部控制的重要性，建议公司根据实际情况和风险承受能力，采取分开保管等措施。这有助于降低潜在的法律风险和舞弊风险，保障公司的合法权益和正常运营。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。