结论：在犯有运输他人偷越国境罪的情况下，通常不可以办理出入通行证。

分析：

1. 法律后果与出入通行证的关系：

   • 运输他人偷越国境是一种严重的违法行为，根据相关法律法规，犯罪者将面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役或管制，并可能并处罚金。
   • 出入通行证（如护照、签证等）是允许个人合法出入国境的官方文件。在犯罪者受到刑事处罚期间或之后，其出入境的自由可能会受到限制，特别是当犯罪涉及国境安全时。

2. 具体限制情况：

   • 根据《中华人民共和国出境入境管理法》等相关法律，犯罪者在服刑期间或刑罚执行完毕但存在特定限制（如未解除的刑事强制措施、未履行完的民事赔偿义务等）时，通常不被允许办理出入通行证或出境。
   • 即使刑罚执行完毕，如果犯罪记录对个人的出入境自由构成长期限制（如被列入不准出境名单），那么个人也将无法办理出入通行证。

3. 特殊情况与例外：

   • 在某些特殊情况下，如犯罪者获得特赦、假释或提前释放，并且相关限制被解除，那么理论上可能有机会申请出入通行证。但这需要满足一系列严格的条件，并经过相关部门的审批。
   • 此外，不同国家和地区对于犯罪记录的处理方式可能不同。如果犯罪者计划前往的国家或地区对犯罪记录有特别要求或限制，那么即使在中国境内可以办理出入通行证，也可能在目的地国遭遇入境障碍。

建议：

• 如果你或你认识的人犯有运输他人偷越国境罪，并希望了解能否办理出入通行证，首先应当咨询当地的出入境管理部门或相关法律机构，以获取最准确和最新的信息。
• 同时，应当认识到犯罪行为的严重性，并积极配合司法机关的调查和处理工作。在刑罚执行期间或之后，遵守相关法律法规和限制条件，努力改正错误并重新融入社会。

后续行动：

• 如果你有进一步的法律问题或需要具体的法律帮助，可以直接向我咨询。我专注于交通事故和合同纠纷领域，但也能就一般法律问题提供基本的指导和建议。