结论：父母将商铺卖给子女后保留收益，要具备法律效力，可通过签订合法有效的合同并明确约定收益保留条款、办理产权变更登记手续、确保交易对价合理且支付方式合法等方式来实现。以下为你详细阐述：

签订合法有效的合同并明确约定收益保留条款

1. 合同形式：父母与子女之间就商铺买卖事宜应当签订书面合同。书面合同能够清晰地记录双方的权利和义务，避免因口头约定而产生争议。合同内容应包括商铺的基本信息（如位置、面积、产权证号等）、交易价格、付款方式、收益保留的具体内容（如保留收益的期限、收益的计算方式、收益的支付方式等）以及违约责任等重要条款。
2. 条款明确性：收益保留条款必须明确具体，不能含糊不清。例如，如果父母保留的是商铺的租金收益，应明确租金的计算标准、收取方式以及保留的期限等。如果保留的是商铺增值部分的收益，应明确增值的计算方法、评估机构的选择等。只有条款明确，才能在发生纠纷时有明确的依据进行判断和处理。
3. 合法性审查：合同内容应符合法律法规的规定，不得违反公序良俗和强制性法律规定。例如，合同中约定的收益保留方式不能涉及非法集资、洗钱等违法活动。如果合同中存在违法条款，该条款将被认定为无效，甚至可能影响整个合同的效力。

办理产权变更登记手续

1. 物权变动效力：根据我国《民法典》的规定，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。父母将商铺卖给子女，必须办理产权变更登记手续，将商铺的产权过户到子女名下，才能使子女取得商铺的所有权。只有在子女取得商铺所有权后，父母保留收益的约定才具有实际意义。
2. 登记程序：办理产权变更登记手续需要双方共同到不动产登记机构申请办理，并提交相关的材料，如身份证、房产证、买卖合同等。不动产登记机构会对申请材料进行审核，审核通过后，会为子女颁发新的房产证，完成产权变更登记。

确保交易对价合理且支付方式合法

1. 对价合理性：父母与子女之间的商铺买卖交易，交易对价应当合理。如果交易价格明显低于市场价格，可能会被税务机关认定为偷税漏税行为，要求补缴税款和滞纳金，甚至可能面临罚款等行政处罚。同时，过低的交易价格也可能影响父母保留收益的合法性和合理性。例如，如果父母以极低的价格将商铺卖给子女，却保留了高额的收益，可能会被认为存在恶意避税或损害其他债权人利益的情况。
2. 支付方式合法：子女支付商铺价款的方式应当合法合规。可以采用银行转账、现金支付等方式，但需要保留好相关的支付凭证，如银行转账记录、收据等。如果采用分期付款的方式，应在合同中明确约定付款的时间、金额和方式等条款，避免因付款问题产生纠纷。

其他注意事项

1. 家庭关系影响：父母与子女之间的交易可能会受到家庭关系的影响，在签订合同和办理手续时，应当保持理性和客观，避免因情感因素而忽视法律风险。例如，不能因为亲情关系而省略必要的合同条款或手续，以免日后产生纠纷。
2. 税务问题：商铺买卖交易涉及多种税费，如契税、增值税、个人所得税等。父母和子女应当了解相关的税收政策，按照规定缴纳税款。如果父母保留收益，也需要考虑收益部分的税务问题，确保税务处理的合法合规。

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