结论：幼儿园以“共青团员不信教”为由辞退员工，一般不合法。以下从多个角度进行分析：
一、法律角度
宗教信仰自由原则：
- 根据我国《宪法》第三十六条，公民有宗教信仰自由，任何国家机关、社会团体和个人不得强制公民信仰宗教或者不信仰宗教，不得歧视信仰宗教的公民和不信仰宗教的公民。
- 幼儿园作为用人单位，无权因员工的宗教信仰（或不信教）而对其进行歧视或辞退。
劳动法保护：
- 根据《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，用人单位解除劳动合同应当符合法定条件，如员工严重违反用人单位规章制度、严重失职等。
- “共青团员不信教”并不构成用人单位解除劳动合同的合法理由。
共青团员身份与宗教信仰：
- 共青团员作为青年中的先进分子，通常倡导科学、进步的思想，但这并不意味着共青团员不能有自己的宗教信仰选择（尽管在实际中，共青团员更倾向于无神论或科学信仰）。
- 重要的是，无论员工是否信仰宗教，都不应成为用人单位辞退的依据。
二、实际操作角度
辞退程序的合法性：
- 即使幼儿园认为员工的行为（如公开宣扬宗教信仰）违反了幼儿园的规章制度，也需要按照法定程序进行辞退，如提前通知、支付经济补偿等。
- 单纯以“共青团员不信教”为由辞退，缺乏合法性和合理性。
证据收集与举证责任：
- 如果幼儿园主张员工因信仰宗教而违反了幼儿园的规章制度，需要提供充分的证据来支持其主张。
- 在没有确凿证据的情况下，幼儿园的辞退行为很可能被认定为违法。
三、建议与后果
对员工的建议：
- 如果员工被幼儿园以“共青团员不信教”为由辞退，可以首先与幼儿园进行协商，要求恢复劳动关系或支付经济补偿。
- 如果协商无果，员工可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
对幼儿园的后果：
- 如果幼儿园的辞退行为被认定为违法，可能需要承担支付经济补偿、赔偿金等法律责任。
- 此外，幼儿园的声誉和形象也可能因此受到损害，影响其未来的招生和运营。
总结：幼儿园以“共青团员不信教”为由辞退员工是不合法的。员工在遇到此类情况时，应勇敢维护自己的合法权益，通过协商或法律途径解决问题。如果你有进一步的法律问题或需要具体的法律帮助，可以直接向我咨询。