结论：分公司关闭时，不可以直接终止孕妇的劳动合同。
法律背景与依据
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，女职工在孕期、产期、哺乳期的，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。这意味着，即使分公司关闭，也不能直接以此为由终止与孕妇的劳动合同。
具体分析
分公司关闭的法律后果：
- 分公司作为公司的分支机构，其关闭通常意味着该分支机构的业务终止，但并不意味着公司本身的终止。因此，分公司关闭时，其员工的劳动合同关系原则上应由公司继续承担。
孕妇劳动合同的特殊性：
- 孕妇在孕期、产期、哺乳期内享有特殊的法律保护。根据《劳动合同法》的规定，用人单位不得在这些特殊时期解除劳动合同，除非孕妇本人存在严重违反公司规章制度、被依法追究刑事责任等法定解除情形。
分公司关闭时的处理方式：
- 如果分公司确实需要关闭，且无法继续承担孕妇的劳动合同关系，公司应考虑与孕妇协商变更劳动合同，如调整工作岗位、工作地点或薪酬等，以尽量维持劳动合同的继续履行。
- 如果协商不成，公司也不能直接终止劳动合同，而应按照法律规定支付经济补偿金，并等待孕妇的孕期、产期、哺乳期结束后，再根据实际情况决定是否续签或终止劳动合同。但需注意，这种做法可能涉及违法解除的风险，因为法律对“三期”女职工的保护是绝对的。
违法解除的后果：
- 如果公司违法解除与孕妇的劳动合同，孕妇有权要求公司继续履行劳动合同或者支付赔偿金。赔偿金的标准通常为经济补偿金的两倍。
法律建议
协商优先：
- 在分公司关闭的情况下，公司应优先与孕妇协商，寻求双方都能接受的解决方案，如调整工作岗位、工作地点或薪酬等。
遵守法律程序：
- 如果协商不成，公司应严格按照法律规定处理与孕妇的劳动合同关系，避免违法解除带来的法律风险。
寻求专业法律帮助：
- 在处理此类复杂问题时，公司应寻求专业律师的法律帮助，以确保处理方式的合法性和合规性。
可能的法律后果
- 如果公司违法解除与孕妇的劳动合同，除了需要支付赔偿金外，还可能面临劳动行政部门的处罚和声誉损失。
- 孕妇也可能因此提起劳动仲裁或诉讼，要求公司承担法律责任。
综上所述，分公司关闭时不可以直接终止孕妇的劳动合同。公司应遵守相关法律法规，与孕妇协商处理劳动合同关系，并寻求专业法律帮助以确保合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。