在自己宅基地上建牛圈是否合法，需结合具体情况判断，以下分情况说明：
合法建设的情况
- 符合规划与审批：若宅基地的使用符合当地村庄规划和土地利用总体规划，且经过相关部门的审批或备案，比如获得了乡村建设规划许可证，并按照许可的范围和要求建设牛圈，那么这样的牛圈建设是合法的。
- 满足环保与安全要求：建设牛圈时，还需考虑环保和安全因素。如果牛圈的建设符合环保标准，如合理处理养殖废弃物、防止环境污染，并且建筑质量符合安全标准，不存在结构安全隐患，那么其合法性会得到进一步确认。
可能构成违法的情况
- 未经审批擅自建设：如果农户在未取得乡村建设规划许可证或其他相关审批手续的情况下擅自建设牛圈，那么该牛圈很可能被认定为违法建筑。即使宅基地本身合法，但未经批准的建设行为仍然违反了相关法律法规。
- 违反规划或改变宅基地用途：如果牛圈的建设违反了当地的村庄规划和土地利用总体规划，比如占用了基本农田、水源保护区等禁止建设的区域，或者超出了宅基地的使用范围，将宅基地主要用于规模化养殖经营，改变了宅基地原本的居住用途属性，那么该牛圈也将被视为违建。
- 存在安全隐患或影响邻里：如果牛圈的建设质量不符合安全标准，存在结构安全隐患，或者对周边环境和居民生活造成了不良影响，如噪音、异味等，那么也可能被相关部门认定为需要整改或拆除的建筑。
法律建议：
- 在决定建设牛圈前，务必先了解当地的政策和规划，咨询相关部门（如乡镇政府的农业农村部门、自然资源部门等）或专业人士的意见，确保建设行为符合法律法规和规划要求。
- 确保取得所有必要的合法审批手续，包括乡村建设规划许可证等，并严格遵守宅基地使用性质和村庄规划的要求进行建设。
- 注意建筑安全和环保标准的遵循，确保牛圈的建设不会对周边环境和居民生活造成不良影响。如果牛圈规模较大或涉及复杂情况，建议寻求专业律师的帮助，以确保建设行为的合法性和合规性。
可能后果：
- 如果未经审批擅自建设牛圈或违反规划要求，可能面临责令停止建设、限期拆除甚至依法强制拆除的风险，并可能承担相应的法律责任。
- 如果牛圈建设存在安全隐患或影响邻里关系，可能引发纠纷或投诉，需要承担相应的整改或赔偿责任。
综上所述，在自己宅基地上建牛圈并非简单的法律问题，而是需要综合考虑多个法律层面和实际因素。只有确保满足所有相关条件和要求，才能确保建设行为的合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。