针对您提出的“违法承包工程的结算怎么办”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、违法承包工程结算的基本原则
违法承包工程，通常指的是违反了《中华人民共和国建筑法》等相关法律法规中关于工程承包、分包的规定。尽管合同可能因违法而无效，但工程款的结算仍需遵循一定的原则，主要是依据《中华人民共和国民法典》第七百九十三条的规定，即如果建设工程经验收合格，可以参照合同关于工程价款的约定进行折价补偿。
二、具体结算情形及处理方式
工程验收合格
- 支付原则：如果工程已经验收合格，发包人应当参照合同约定支付工程款，这包括计价方式、支付时间等关键条款。
- 利息支付：若发包人未按时支付工程款，还需支付欠付工程款的利息，利息从应付工程价款之日开始计付，标准一般按照全国银行间同业拆借中心公布的同期同类贷款市场报价利率计算。
- 协商与诉讼：如果双方无法就工程款结算达成一致，承包人可以依法向人民法院提起诉讼，通过法律途径解决争议。
工程验收不合格但可修复
- 修复责任：如果工程验收不合格，但经过修复可以达到合格标准，那么修复费用应由承包人承担。
- 支付调整：发包人在支付工程款时，可以从中扣除修复费用，确保工程款的支付与工程质量相匹配。
工程验收不合格且无法修复
- 无权请求：如果工程验收不合格且无法修复，承包人将无权请求参照合同关于工程价款的约定进行折价补偿。
- 发包人权利：发包人有权拒绝支付工程款，并可以要求承包人承担相应的违约责任，包括赔偿因工程质量问题造成的损失。
三、法律责任与后果
- 行政处罚：根据《中华人民共和国建筑法》的相关规定，违法承包工程的单位或个人可能面临责令改正、没收违法所得、罚款等行政处罚。
- 连带赔偿责任：如果因违法承包工程导致工程质量问题，造成损失的，承包单位与相关责任方需承担连带赔偿责任。
四、注意事项与建议
- 证据保留：在进行工程款结算时，双方应确保工程已经过验收，并收集保存好相关证据，如合同、施工图纸、工程量清单、签证单、施工记录、验收报告等，以证明实际施工情况和工程款金额。
- 协商解决：遇到争议时，应首先尝试通过协商的方式解决，这有助于维护双方的关系，并降低解决争议的成本。
- 法律咨询：由于违法承包工程的结算涉及复杂的法律问题，建议相关当事人在遇到此类问题时咨询专业律师，以确保自身权益得到妥善处理。
综上所述，违法承包工程的结算需综合考虑多个因素，包括工程验收情况、合同约定以及法律法规等。双方应依法行事，保留好相关证据，并在必要时寻求法律援助，以确保工程款的合理合法结算。