结论：面对邻居在农村自建房挖地基且态度强硬不愿签署协议的情况，你可以通过沟通协商、寻求第三方调解、收集证据准备法律途径以及向相关部门反映等多种方式来维护自己的合法权益。

详细分析：

1. 沟通协商：

   • 首先，尝试与邻居进行友好、理性的沟通，明确表达你的担忧和诉求，比如担心挖地基可能影响你家房屋的安全等。
   • 强调签署协议的重要性，协议可以明确双方的权利和义务，避免未来可能出现的纠纷。
   • 如果邻居仍然态度强硬，可以尝试提出一些妥协方案，比如共同委托第三方进行地基安全评估等。

2. 寻求第三方调解：

   • 如果沟通协商无果，可以考虑寻求村委会、乡镇政府或相关调解组织的帮助，请求他们介入调解。
   • 调解组织通常具有中立性和专业性，能够更有效地促进双方达成和解。
   • 在调解过程中，保持冷静和理性，积极配合调解工作，争取达成一个双方都能接受的协议。

3. 收集证据准备法律途径：

   • 如果邻居的行为已经对你的房屋安全造成了实际影响，或者你担心未来可能发生纠纷，可以开始收集相关证据。
   • 证据可以包括现场照片、视频、证人证言等，用于证明邻居挖地基的行为以及可能对你造成的损害。
   • 咨询专业律师（即我，阎书波律师，专注于合同纠纷、婚姻家庭领域），了解你的法律权益和可能的法律途径，如起诉要求邻居停止侵害、赔偿损失等。

4. 向相关部门反映：

   • 如果邻居的挖地基行为违反了当地的建筑规划、土地管理等相关规定，你可以向当地的规划部门、土地管理部门等反映情况。
   • 相关部门有权对违规行为进行查处，并可能要求邻居停止侵害、恢复原状等。

后续行动建议：

• 在采取任何行动之前，确保你已经充分了解了相关的法律法规和政策，以便更好地维护自己的权益。
• 保持冷静和理性，避免与邻居发生不必要的冲突和争执。
• 如果可能的话，尽量与邻居保持友好关系，通过协商和调解解决问题，以维护邻里和谐。

法律背景：

• 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。
• 如果邻居的行为侵犯了你的合法权益，你有权要求邻居停止侵害、排除妨碍、赔偿损失等。

如有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。