针对您提出的事业单位自动离职有争议的问题，这确实是一个需要细致处理的情况。以下是我为您详细梳理的解决方案及处理过程中的关键注意事项，希望能帮助您妥善解决这一纠纷。

一、解决方案

1. 与单位协商沟通

   • 主动沟通：首先，我建议您尽快与单位的人事部门取得联系，诚恳地说明您自动离职的具体原因，并表达您希望友好解决争议的意愿。
   • 倾听单位意见：在沟通过程中，认真听取单位对自动离职的看法和要求，尝试通过双方的理解与沟通，找到一个双方都能接受的解决方案。

2. 向单位内部申诉渠道反映

   • 了解申诉流程：查阅您所在单位的规章制度，明确内部申诉的具体步骤和要求，确保您的申诉符合单位规定。
   • 准备申诉材料：整理详细的申诉资料，包括离职原因、您的诉求以及您认为合理的解决办法，通过单位的内部申诉机制来争取您的权益。

3. 寻求上级主管部门调解

   • 整理书面材料：将纠纷的详细情况，包括事件经过、与单位的沟通记录以及您掌握的相关证据，整理成书面材料。
   • 提出调解请求：向上级主管部门提交这份材料，请求他们介入调解，以促使双方达成一个合理的解决方案。

4. 申请劳动人事争议仲裁

   • 注意仲裁时效：劳动人事争议仲裁的时效一般为一年，从您知道或应当知道权利被侵害之日起计算，因此请务必及时行动。
   • 提交申请与证据：向当地劳动人事争议仲裁委员会提出申请，并提供劳动合同、工资条、工作证、考勤记录等相关证据，仲裁委员会将依法进行审理并作出裁决。

5. 提起诉讼

   • 准备诉讼材料：如果您对仲裁结果不满意或仲裁不予受理，您可以撰写起诉状，详细阐述纠纷事实、理由及您的诉讼请求，并提交相关证据。
   • 参与诉讼程序：按照法院的要求参加庭审，进行举证、质证和辩论，法院的判决具有强制执行力。

二、处理过程中的注意事项

• 明确法律依据：在处理纠纷的过程中，深入了解相关的法律法规和政策规定，确保您的行为合法合规，这是维护您权益的基础。
• 保留关键证据：收集并妥善保存所有与离职相关的证据，如劳动合同、工资单、离职证明、沟通记录等，这些证据将在后续的协商、申诉、仲裁或诉讼中发挥重要作用。
• 及时采取行动：发现纠纷后，请务必及时处理，避免问题扩大化或错过解决的最佳时机，以免给您带来不必要的损失。
• 咨询专业人士：在处理过程中，如果您感到困惑或不确定如何操作，可以寻求专业律师或法律顾问的帮助，他们将为您提供专业的法律建议和支持。

综上所述，事业单位自动离职纠纷的解决方式多样，您应根据自己的具体情况选择最合适的途径来维护自己的合法权益。在整个过程中，保持冷静、理性，并遵循法律法规的要求是至关重要的。希望这些建议能对您有所帮助，如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。