学校确实会核查就业协议的真实性，而且这一核查过程是由教育部高度重视并严格要求的。教育部为了保障高校毕业生就业数据的真实性和准确性，专门下发了相关通知，并召开了各省教育部门的核查部署会议。他们派出了多个工作组，直接深入到高校和院系中，通过检查就业数据自查清单、核对自查报告、抽查相关就业佐证材料等多种方式，来逐一核实就业数据的真实性。

在核查过程中，如果发现存在虚假签约、虚假证明等违规行为，教育部会责成有关部门依规依纪进行严肃处理，并追究相关高校和人员的责任。这是为了切实维护高校毕业生的就业合法权益，确保他们能够在真实、公平的就业环境中找到适合自己的工作。

此外，教育部还要求各地各高校严格执行就业工作的“四不准”“三不得”规定，这些规定旨在防止高校在就业工作中出现不正当行为，如强迫毕业生签订就业协议、将毕业证书与签约挂钩等。同时，教育部还强调了对灵活就业等相关数据的重点核查，以“零容忍”的态度严肃查处就业违规行为。

因此，可以明确地说，学校会查就业协议的真实性，而且这一核查过程是非常严格和细致的。作为毕业生，你应该确保自己提供的就业协议是真实有效的，以避免因虚假签约而带来的不必要的麻烦和风险。