您好，关于您提出的“农村户口不上公积金是否合法”的问题，我可以为您详细解答。

首先，我们需要明确的是，根据《住房公积金管理条例》以及相关的指导意见，国家机关、国有企业、城镇集体企业、外商投资企业、城镇私营企业及其他城镇企业、事业单位、民办非企业单位、社会团体（以下统称单位）及其在职职工，都应当按照《住房公积金管理条例》的规定缴存住房公积金。这里并没有特别指出农村户口的员工可以免缴。

进一步来说，虽然有些地区或特定情况下，对于城镇单位聘用进城务工人员（可能包括部分农村户口员工）的住房公积金缴存，可能有一定的灵活性或特殊规定，但这并不意味着农村户口员工就可以完全不缴存住房公积金。实际上，只要员工与单位签订了劳动合同，且该单位属于上述应缴存住房公积金的单位范畴，那么单位就有义务为员工缴存住房公积金。

因此，如果单位以员工是农村户口为由拒绝为其缴存住房公积金，这是不合法的。员工有权要求单位为其补缴工作期间应缴纳的住房公积金。

另外，如果您已经遇到了这样的情况，即单位拒绝为您缴存住房公积金，您可以先与单位进行协商，要求单位按照法律规定为您缴存。如果协商无果，您可以向当地的住房公积金管理中心进行投诉或举报，他们会根据相关法律法规进行调查处理。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。