国有企业负责人被立案留置期间，工资原则上暂停发放，但保留劳动关系，留置结束后根据处理结果决定是否补发及后续工资待遇。具体分析如下：

1. 留置期间的工资处理原则
   根据《中华人民共和国监察法》第四十四条第三款规定，被留置人员属于涉嫌严重职务违法或职务犯罪的公职人员。国有企业负责人作为国家工作人员（或参照国家工作人员管理的人员），在留置期间工资暂停发放，但劳动关系仍保留。这是因为留置是监察机关的强制措施，期间被调查人无法正常履职，工资发放缺乏对价基础。

2. 留置结束后的工资处理分情况

   • 若经调查无违法犯罪行为：留置期间应补发工资，并恢复原工资待遇。依据《监察法》第四十四条，监察机关需在解除留置后三日内通知所在单位，单位应立即恢复其职务、岗位及工资。
     
   • 若被给予政务处分（如警告、记过等）：根据处分种类，可能扣发部分绩效工资或奖金，但基本工资通常保留。例如，受警告处分期间，可能仅影响年度考核奖金。
     
   • 若被移送司法机关并定罪：根据《刑法》第三百八十三条（贪污罪）或第三百八十五条（受贿罪）等条款，若被判处刑罚，工资待遇按《关于事业单位工作人员和机关工人被采取强制措施和受行政刑事处罚工资待遇处理有关问题的通知》执行，通常停发工资，改发生活费；若被宣告缓刑，可能降低岗位等级并停发绩效工资。

3. 特殊情形：非国家工作人员的国企负责人
   若该负责人不属于国家工作人员（如通过市场化招聘的职业经理人），留置期间工资处理需参照《劳动合同法》及企业规章制度。若企业章程或劳动合同未明确规定，实践中可能参照公职人员处理方式暂停发放，但最终需通过劳动仲裁或诉讼解决争议。

建议：若涉及具体案件，需结合留置原因（如贪污、受贿还是滥用职权）、企业性质（如是否为中央企业）及地方政策进一步分析。如有疑问，可直接向我咨询细节。