结论：承包人用承包地置换集体机动地，在面积相等且符合法定程序与条件的情况下，是合法的；但若未遵循法定程序或条件，则可能不合法。
分析说明：
合法性前提：
- 法定程序：根据《农村土地承包法》及相关规定，土地承包经营权的流转，包括互换，应当遵循法定程序。这通常包括双方协商一致、签订书面合同、报发包方备案等步骤。若村组领导仅通过协商就决定置换，而未履行必要的法定程序，如未签订书面合同或未报发包方备案，则可能构成程序违法。
- 条件符合：置换的土地应当符合土地利用总体规划和城乡规划，且不得改变土地的农业用途。此外，置换双方应当具有合法的土地承包经营权，且置换行为不得损害其他集体成员的合法权益。若机动地未发包，但属于集体所有，且置换行为符合上述条件，则可能具有合法性。
非法性情形：
- 程序违法：如前所述，若置换行为未遵循法定程序，如未签订书面合同、未报发包方备案等，则可能构成程序违法，从而影响置换的合法性。
- 条件不符：若置换的土地不符合土地利用总体规划或城乡规划，或者改变了土地的农业用途，或者置换行为损害了其他集体成员的合法权益，则置换行为可能不合法。
村组领导协商的角色：
- 村组领导在置换过程中可以发挥协商和调解的作用，但其协商结果必须符合法定程序和条件才能具有法律效力。若村组领导仅通过协商就决定置换，而未确保置换行为符合法定程序和条件，则其协商结果可能不具有法律效力。
法律建议：
- 核实程序：承包人应核实置换行为是否已遵循法定程序，包括是否签订书面合同、是否报发包方备案等。
- 检查条件：承包人应检查置换的土地是否符合土地利用总体规划和城乡规划，是否未改变土地的农业用途，以及置换行为是否未损害其他集体成员的合法权益。
- 咨询专业意见：若承包人对置换行为的合法性存在疑问，建议咨询专业律师或相关政府部门，以获取更准确的法律意见和指导。
可能后果：
- 合法置换：若置换行为符合法定程序和条件，则承包人可以依法取得机动地的承包经营权，并享受相应的权益。
- 非法置换：若置换行为不符合法定程序或条件，则可能面临置换无效、恢复原状、赔偿损失等法律后果。此外，还可能受到相关政府部门的行政处罚。