在劳动仲裁中，如果只仲裁了公司而没有仲裁门店，这并不一定会影响你的仲裁请求，但具体是否产生影响，需要分情况来看：

1. 门店与公司法律关系明确：

   • 如果门店是公司的分支机构，且没有独立的法人资格，那么从法律上讲，门店的行为后果应由公司承担。在这种情况下，即使你只仲裁了公司，而没有直接仲裁门店，仲裁结果仍然可能对你有效，因为公司需要为其分支机构的行为负责。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国公司法》第十四条：“公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。”

2. 门店与公司法律关系不明确或存在独立法人资格：

   • 如果门店是独立法人，或者虽然不是独立法人但与公司之间的法律关系不明确，那么只仲裁公司可能不足以完全解决你的问题。因为门店作为独立的经营实体，可能需要对其自身的行为承担责任。
   • 建议：在这种情况下，你可以考虑在仲裁过程中申请追加门店为共同被申请人，或者如果仲裁结果已经作出但未涉及门店，你可以在后续的法律程序中（如诉讼）考虑将门店列为被告。

3. 仲裁请求的具体内容：

   • 你的仲裁请求具体是什么也会影响是否需要仲裁门店。例如，如果你的请求仅涉及公司层面的决策或行为（如解雇、薪资调整等），那么只仲裁公司可能是足够的。
   • 但如果你的请求涉及门店的具体操作或行为（如门店未支付加班费、门店违反劳动合同等），那么将门店列为被申请人可能更为合适。

4. 实际操作中的灵活性：

   • 劳动仲裁机构在处理案件时，通常会根据案件的具体情况和法律规定来灵活处理。如果你在仲裁过程中发现需要追加门店为被申请人，可以向仲裁机构提出申请，并说明理由。
   • 流程提示：一般来说，追加被申请人需要在仲裁庭辩论终结前提出，并需要提供相关证据证明门店与案件的关联性。

总结与建议：

• 在劳动仲裁中，是否仲裁门店取决于门店与公司的法律关系以及你的仲裁请求的具体内容。
• 如果门店是公司的分支机构且无法人资格，通常只需仲裁公司。
• 如果门店是独立法人或法律关系不明确，且你的请求涉及门店的具体行为，建议考虑追加门店为共同被申请人。
• 在实际操作中，保持与仲裁机构的沟通，并根据案件进展灵活调整策略。

如果你在处理此类问题时遇到任何困难或不确定之处，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。