针对你提出的问题，即仲裁申请书上立案时只仲裁了公司的分店，而还未开庭的情况，以下是我的建议：

首先，结论是你可以考虑向仲裁委员会提出变更或增加仲裁被申请人的申请。

1. 分析当前情况：

   • 你已经提交了仲裁申请书，但只针对了公司的分店。
   • 仲裁尚未开庭，因此仍有机会对仲裁申请进行修改或补充。

2. 法律建议：

   • 提出变更或增加被申请人的申请：你可以向仲裁委员会提出书面申请，要求变更或增加仲裁被申请人，将总公司或其他相关分支机构也纳入仲裁范围。这通常需要在开庭前提出，并附上相应的证据材料，如公司架构图、分店与总公司之间的关系证明等。
   • 说明理由：在申请中，你需要明确说明为什么要求变更或增加被申请人。例如，你可能认为分店无法独立承担全部责任，或者总公司对分店的行为负有连带责任等。
   • 准备证据：为了支持你的申请，你需要准备充分的证据材料。这可以包括合同、交易记录、公司注册信息、内部文件等，以证明分店与总公司之间的关系以及你的仲裁请求的合理性。

3. 注意事项：

   • 及时提出：务必在开庭前提出变更或增加被申请人的申请，以免错过时机。
   • 遵循程序：按照仲裁委员会的规定和程序提交申请，并确保所有材料齐全、合规。
   • 沟通协商：在提出申请前，你可以尝试与对方进行沟通协商，看是否能够达成和解或调解，以避免不必要的仲裁程序。

4. 后续行动：

   • 提交申请后，密切关注仲裁委员会的反馈和决定。
   • 根据仲裁委员会的指示，及时补充材料或进行其他必要的操作。
   • 准备开庭前的各项工作，包括整理证据、准备辩论提纲等。

总之，由于仲裁尚未开庭，你仍有机会对仲裁申请进行修改或补充。建议你及时向仲裁委员会提出变更或增加被申请人的申请，并附上充分的证据材料以支持你的请求。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。