关于员工请假工资的扣除方式，需结合请假类型、公司规章制度及法律法规综合判断，常见计算方式包括按天扣除或按实际出勤天数折算工资。具体分析如下：

1. 按天扣除工资
   若员工请的是事假，根据《工资支付暂行规定》及多数地方规定，用人单位无需支付事假期间的工资。此时工资扣除方式通常为：

   • 月工资÷21.75天（月计薪天数）×请假天数（例如：月工资5000元，请假2天，则扣除5000÷21.75×2≈459.77元）。
     
   • 前提：公司规章制度需明确事假无薪，且扣除后工资不得低于当地最低工资标准。

2. 按实际出勤天数折算工资
   若员工请的是病假、婚假、产假等法定带薪假，或公司规章制度规定部分带薪假（如年假），则工资计算方式为：

   • 月工资×（实际出勤天数÷应出勤天数）（例如：月工资5000元，应出勤22天，实际出勤18天，则工资=5000×18÷22≈4090.91元）。
     
   • 特殊情形：病假工资通常按当地规定比例支付（如不低于最低工资的80%），产假工资则由生育津贴或公司按原工资标准支付。

3. 关键注意事项

   • 公司规章制度合法性：扣除方式需经民主程序制定（如职工代表大会讨论）并公示，否则可能被认定为违法。
     
   • 最低工资保障：扣除后工资不得低于当地最低工资标准（如北京为2420元/月）。
     
   • 加班工资计算基数：若涉及加班费，需以扣除请假工资前的应发工资为基数计算。

建议：员工可先查阅公司《员工手册》或劳动合同中关于请假工资的规定；若公司扣除方式违法（如事假按双倍扣除、病假未支付法定比例工资），可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。如有具体案例，可进一步提供细节，我会为您详细分析。