针对您提出的问题，即“病历本都扔了多年在农村死了还能开死亡证明吗”，以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，死亡证明的开具并不完全依赖于病历本的存在。死亡证明的开具主要依据的是死亡事实以及相关的调查和核实程序。
在农村地区，如果有人在非医疗卫生机构（如家中）正常死亡，通常的处理流程是：
家属申报：死者的家属需要向当地的乡镇（街道）卫生院（社区卫生服务中心）进行申报，说明死亡情况。
调查核实：卫生院或社区卫生服务中心会根据家属的申报材料，进行必要的调查和核实。这可能包括询问家属、邻居或相关目击者，以确认死亡事实和相关情况。
开具证明：在调查核实无误后，乡镇（街道）卫生院（社区卫生服务中心）会开具居民死亡医学证明（推断）书，即我们通常所说的死亡证明。
针对您提到的“病历本都扔了多年”的情况，这并不会直接影响死亡证明的开具。因为死亡证明的开具主要关注的是死亡事实本身，而不是病历本的保存情况。当然，如果病历本中包含了与死亡相关的医疗信息，这些信息在调查核实过程中可能会被参考，但并非必需。
另外，如果死者已经办理了户籍注销及殡葬手续，且需要补办死亡证明，根据相关规定，死者的家属或委托人可以持有效身份证件向签发单位（即乡镇（街道）卫生院或社区卫生服务中心）申请补发一次。但需要注意的是，补发的死亡证明通常只有第三联（如果已办理相关手续的话）。
最后，需要强调的是，死亡证明的开具是一项严肃的法律程序，必须确保信息的真实性和准确性。因此，在申请开具或补办死亡证明时，请务必提供真实、有效的信息和材料。
综上所述，即使病历本已经丢失多年，在农村地区仍然可以按照规定的流程开具死亡证明。希望这个解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。