结论：短信通知欠款二次上报征信且配偶同步是否合法，需分情况讨论，主要取决于债务性质、配偶是否知情及同意等因素。以下从不同角度进行详细分析：
一、债务性质对征信上报合法性的影响
个人债务：
- 若债务为个人债务，即仅由一方承担还款责任，且未明确约定为夫妻共同债务，那么上报征信的行为原则上应仅针对债务人本人。
- 在此情况下，若短信通知中提及将配偶信息同步上报征信，可能涉及侵犯配偶的隐私权，除非配偶明确同意或该债务被认定为夫妻共同债务。
夫妻共同债务：
- 若债务被认定为夫妻共同债务，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，夫妻双方均有还款责任。
- 在此情况下，上报征信的行为可能涉及夫妻双方，但需确保上报信息的准确性和合法性，且应遵循相关法律法规关于征信管理的规定。
二、配偶知情及同意对征信上报合法性的影响
配偶知情且同意：
- 若配偶对债务情况知情，并明确同意将其信息上报征信，那么该行为在法律上可能是合法的。
- 但需注意，即使配偶同意，上报征信的行为也应遵循相关法律法规的规定，确保信息的准确性和合法性。
配偶不知情或不同意：
- 若配偶对债务情况不知情，或明确表示不同意将其信息上报征信，那么该行为可能构成侵犯隐私权。
- 在此情况下，配偶有权要求停止上报征信，并可能寻求法律救济。
三、征信上报的合法程序及要求
合法程序：
- 上报征信应遵循相关法律法规的规定，包括但不限于《征信业管理条例》等。
- 上报前应确保信息的准确性、完整性和合法性，并遵循必要的告知和同意程序。
要求：
- 征信机构应确保上报信息的真实性和准确性，不得虚构或夸大事实。
- 上报征信的行为应遵循公平、公正、公开的原则，不得损害他人的合法权益。
四、法律建议
核实债务性质：
- 首先应核实债务是否为夫妻共同债务，以确定上报征信的行为是否涉及配偶。
与债权人沟通：
- 若对上报征信的行为有异议，建议与债权人进行沟通，了解上报的具体原因和依据。
寻求法律救济：
- 若认为上报征信的行为侵犯了自己的合法权益，如隐私权等，可以寻求法律救济，包括但不限于向征信机构提出异议、向法院提起诉讼等。
进一步思考：在实际操作中，上报征信的行为往往涉及复杂的法律关系和利益平衡。因此，在处理此类问题时，建议综合考虑债务性质、配偶的知情及同意情况、征信上报的合法程序及要求等多方面因素。若您对此类问题仍有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。