结论：再审依旧认定超过诉讼时效，原告不服的，一般情况下不可以直接向最高院申诉，但存在特定情形时，可通过申请检察建议或者抗诉的方式，由检察机关向最高院提出相关请求。

分析说明：

1. 一般情形下的申诉限制：

   • 根据我国现行法律体系，再审程序是民事诉讼中的特殊救济程序，旨在纠正已经发生法律效力的判决、裁定中的错误。当再审程序已经启动并作出裁定后，通常意味着该案件在司法程序上的救济途径已经基本穷尽。
   • 在再审裁定已经明确认定案件超过诉讼时效的情况下，原告若不服该裁定，一般不能直接向最高人民法院（最高院）提出申诉。因为申诉并非法律规定的正式诉讼程序，且最高院通常不直接受理对下级法院再审裁定的直接申诉。

2. 特定情形下的救济途径：

   • 申请检察建议或抗诉：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，如果原告认为再审裁定存在错误，特别是涉及诉讼时效的认定等法律适用问题，可以向人民检察院申请检察建议或者抗诉。人民检察院在审查后，如果认为符合抗诉条件，可以向同级人民法院提出抗诉，或者提请上级人民检察院向其同级人民法院提出抗诉。在特定情况下，这可能涉及向最高院提出抗诉或检察建议。
   • 其他非诉讼途径：除了申请检察建议或抗诉外，原告还可以考虑通过信访等非诉讼途径表达诉求，但这些途径并不改变原判决、裁定的法律效力，也不直接启动司法程序。

3. 诉讼时效的法律意义：

   • 诉讼时效是法律规定的请求权行使的期限限制，超过诉讼时效期间，权利人将丧失胜诉权。因此，在再审程序中，如果法院认定案件超过诉讼时效，将依法驳回原告的诉讼请求。
   • 原告在提起诉讼时，应当充分注意诉讼时效的问题，确保在法定期限内行使权利，以避免因超过诉讼时效而丧失胜诉权。

行动建议：

• 评估案件情况：原告应首先评估案件的具体情况，包括诉讼时效的起算点、中断或中止的情形等，以确定是否确实存在超过诉讼时效的问题。
• 咨询专业律师：如果原告对再审裁定不服，建议咨询专业律师，了解具体的法律救济途径和可能性。律师可以根据案件的具体情况，为原告提供专业的法律意见和诉讼策略。
• 考虑申请检察建议或抗诉：如果律师认为存在申请检察建议或抗诉的可能性，原告可以按照法律规定的程序向人民检察院提出申请。

法律后果：

• 如果原告未能在法定期限内行使权利，导致超过诉讼时效，将可能面临败诉的风险。
• 如果原告通过申请检察建议或抗诉等途径获得救济，并成功启动再审程序，则有可能改变原判决、裁定的结果。但这一过程需要满足严格的法律条件和程序要求。