申请劳动仲裁本身并不直接等同于离职，劳动关系的存续或解除需依据具体情况及法律规定来确定。以下是对这一问题的详细分析：
劳动关系存续的情况：
- 如果劳动者在申请仲裁时并未明确表示离职，且继续按照用人单位的要求正常出勤、提供劳动，同时用人单位也持续为劳动者发放工资、缴纳社保等，那么双方的劳动关系依然有效存续。例如，劳动者可能因用人单位拖欠加班工资而提起劳动仲裁，但在此期间仍然坚持到岗工作，这种情况下劳动关系并未解除。
劳动关系解除的情况：
- 劳动者主动解除：劳动者有权以书面等明确方式向用人单位提出离职，如提交辞职信。即便此时劳动仲裁正在进行中，从离职通知到达用人单位并符合相关法律规定的离职程序时起，劳动关系即告解除。
- 用人单位解除：用人单位在劳动仲裁期间也可能因合理合法的理由（如劳动者严重违反规章制度）而解除与劳动者的劳动关系。但这种解除必须严格遵守法律规定的条件和程序，否则可能构成违法解除，劳动者有权在仲裁中主张相应权益。
- 仲裁裁决或法院判决解除：在某些情况下，劳动仲裁裁决或法院判决可能会明确解除劳动关系。这通常发生在劳动争议涉及劳动合同无效、解除劳动合同等核心问题时。一旦裁决或判决生效，劳动关系即告解除。
法律建议：
- 在申请劳动仲裁前，劳动者应明确自己的诉求和目的。如果希望继续留在用人单位工作，那么在仲裁期间应继续履行劳动合同和公司规定中的职责和义务。
- 如果劳动者已经决定离职，或者与用人单位之间的矛盾已经激化到无法继续工作的地步，那么可以在办理离职手续后申请劳动仲裁。但需要注意的是，即使办理了离职手续，劳动者仍然有权就离职前的劳动争议申请仲裁。
- 在整个过程中，劳动者应保留好相关证据，如工资条、考勤记录、劳动合同等，以便在仲裁或诉讼中证明自己的权益。
可能后果：
- 如果劳动者在仲裁期间擅自离职，可能会被视为违反劳动合同和公司规定，用人单位有权据此解除劳动合同，并且可能不需要支付经济补偿金。
- 如果用人单位在仲裁期间违法解除劳动合同，劳动者有权要求恢复劳动关系或者获得相应的经济补偿金或赔偿金。
总之，申请劳动仲裁与离职之间没有必然的因果联系。劳动关系的存续或解除需根据劳动者和用人单位的具体行为、相关证据以及法律规定来综合判断。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。