结论前置：
- 旷工三天自动离职，用人单位不能随意扣工资，扣除工资需基于合理依据且不得低于最低工资标准，且此行为无需劳动者写申请。
- 若用人单位规章制度有明确规定且已公示，可按规章制度处理，但扣除工资仍需合理。
详细分析：
首先，我们需要明确的是，旷工三天自动离职这一行为，本身并不直接决定用人单位可以扣除多少工资。我国现行法律中并未明确规定旷工几天算自动离职，旷工属于违反用人单位规章制度的行为，其处理应依据用人单位依法制定并公示的规章制度。但即便规章制度中有相关规定，用人单位在扣除工资时也需遵循合理、合法的原则。
工资扣除的合理范围：
- 用人单位若因旷工扣除工资，扣除部分应与劳动者旷工所造成的实际损失相当。通常做法是按天扣除旷工期间的工资，但扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。这是为了保护劳动者的基本生活需求，防止用人单位滥用权力。
- 例如，如果劳动者旷工三天，用人单位不能因此扣除其整个月的工资，而只能扣除这三天应得的工资部分，且扣除后的工资总额不得低于最低工资标准。
规章制度的制定与公示：
- 用人单位的规章制度需依法制定并公示，才能作为处理劳动者的依据。如果规章制度中明确规定了旷工三天属严重违反规章制度，可按自动离职处理，并规定了相应的工资扣除标准，那么用人单位在处理时需遵循这些规定。
- 但即便如此，扣除工资的标准也需合理，不得违反法律法规的强制性规定，如不得低于最低工资标准。
无需劳动者写申请：
- 旷工三天自动离职并扣除工资的行为，是用人单位根据规章制度对劳动者的处理，无需劳动者写申请。劳动者只需了解并遵守用人单位的规章制度，以及在处理结果有异议时，通过合法途径维护自己的权益。
劳动者的维权途径：
- 如果劳动者对用人单位的工资扣除行为有异议，可以先与用人单位协商解决。如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
实际操作建议：
- 在面临旷工及工资扣除问题时，劳动者应先查看用人单位的规章制度或咨询相关部门负责人，了解具体的扣工资规定。
- 如对处理结果有异议，应及时向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
举例说明：
假设某公司规章制度中规定，旷工三天属严重违反规章制度，可按自动离职处理，并扣除旷工期间的工资。如果劳动者小李旷工三天，公司只能扣除小李这三天应得的工资部分，且扣除后的工资总额不得低于当地最低工资标准。如果公司扣除的工资超过了这一范围，小李有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
综上所述，旷工三天自动离职并扣除工资的行为，需遵循合理、合法的原则，且无需劳动者写申请。劳动者在面对此类问题时，应了解自己的权益和维权途径，以维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。