关于“先收发票后付款是否合法”的问题，这主要取决于交易双方的合同约定以及相关法律法规的规定。在合同明确约定且不违反法律法规的前提下，这种操作方式是合法的。
法律层面分析
从法律角度来看，我国现行法律并未对开票和付款的先后顺序作出强制性规定。《中华人民共和国发票管理办法》及其实施细则主要规范的是发票的开具、使用和管理，并未明确禁止“先收发票后付款”的交易方式。因此，只要交易真实存在且发票开具合规，这种操作方式并不违法。
商业实践与交易习惯
在商业活动中，“先收发票后付款”是一种相对常见的操作模式。许多企业出于财务结算便利、交易流程顺畅等考虑，会采用这种方式进行交易。特别是大型企业，其内部往往有严格的财务付款流程，通常要求先收到供应商开具的发票，再经过财务审核等一系列程序后安排付款。这种做法在实践中被广泛接受，并形成了一定的商业习惯。
潜在风险及应对措施
尽管“先收发票后付款”在商业实践中较为常见，但它也可能给收款方带来一定的风险，如付款方可能在收到发票后拖延付款甚至拒绝付款。为防范此类风险，收款方可以采取以下措施：
合同明确约定：在合同中明确规定先开发票后付款的条款，并注明发票仅作为收款凭证，不代表买方已付款。例如，可以约定“发票的开具不视为买方履行付款义务的证明，买方需按合同约定时间和方式支付货款”。
保留交易证据：保存合同、送货单、收货单、对账单等交易相关证据，以证明货物或服务已交付且买方未付款。
约定逾期付款的违约责任：对付款方逾期付款的行为进行约束，确保其按时履行付款义务。
要求对方出具收到发票的回执：在交付发票时，要求付款方出具回执，注明发票的具体信息以及款项尚未支付等内容。这不仅可以作为后续主张权利的证据，还能增强交易的透明度和可追溯性。
税务考量与合规性
从税务角度来看，“先收发票后付款”也需谨慎处理。交易双方应确保发票的开具与付款行为符合税法规定，避免被认定为虚开发票等税务风险。例如，发票的开具应与实际交易相符，不得虚开、代开或开具与实际交易不符的发票。
总结与建议
综上所述，“先收发票后付款”在合同明确约定且不违反法律法规的前提下是合法的。然而，为避免潜在风险和纠纷，交易双方应谨慎处理相关事宜。建议在合同中明确约定相关条款，并采取必要的保障措施来降低风险。如遇具体问题或疑虑，建议咨询专业法律人士或税务专家以获取准确的法律意见和税务指导。