另行签订协议约定不退费，是否合法取决于具体情况：
基于双方真实意愿且不违反法律规定时合法：
- 如果双方在签订协议时均出于自愿，且对该“不退费”条款有明确的认知，同时该条款没有违反法律法规的强制性规定，没有危害社会公共利益或他人合法权益，那么这一约定就是合法有效的。
- 根据《民法典》第一百四十三条，民事法律行为有效的条件包括行为人具备相应的民事行为能力、意思表示真实以及不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。因此，在符合这些条件的情况下，“不退费”的约定是合法的。
可能存在不合法的情形：
- 如果协议中的“不退费”条款导致一方因此取得了不当利益，或者造成了他人损失，则该条款可能是不合法的。根据《民法典》第一百三十二条，民事主体不得滥用民事权利损害国家利益、社会公共利益或者他人合法权益。
综上所述，另行签订协议约定不退费，并不直接判定其合法性，而是需要根据双方签订协议时的具体情况、条款内容以及是否违反相关法律法规来综合判断。如你有相关法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我专注于合同纠纷及建设工程领域，很乐意为你提供专业解答。