企业将职工派遣到关联单位从事工作，工资发放通常按以下方式处理：

1. 遵循派遣协议约定：企业与关联单位之间应签订劳务派遣协议，协议中需明确约定工资的支付主体、支付标准、支付时间等关键条款。若协议约定由企业支付工资，则企业应按照约定时间和标准，通过银行转账或现金等方式直接支付给职工；若协议约定由关联单位支付工资，企业应确保关联单位按时足额支付，并保留好相关支付凭证，以备后续核查。
2. 确保工资不低于法定标准：无论工资由哪方支付，都必须确保职工的工资水平不低于当地政府规定的最低工资标准，且应包含基本工资、加班工资、奖金等所有应得收入。这是企业的法定义务，也是保障职工合法权益的重要体现。
3. 依法代扣代缴个人所得税及社保：企业在支付工资时，应依法代扣代缴职工的个人所得税，并按照规定为职工缴纳社会保险费。若工资由关联单位支付，企业应与关联单位明确各自在社保缴纳方面的责任，确保职工的社保权益不受损害。
4. 保留工资支付记录：企业应妥善保存工资支付记录，包括工资单、银行转账记录等，以备劳动监察部门或职工本人查询。这些记录是证明企业已履行工资支付义务的重要证据，也是处理劳动争议时的重要依据。

在处理此类问题时，企业还需注意与关联单位之间的沟通协调，确保双方在工资支付、社保缴纳等方面保持一致，避免出现因信息不对称或责任划分不清而引发的劳动争议。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请随时向我咨询。