关于协商离职是否需要走系统的问题，这实际上取决于您所在公司的具体规定和流程。不过，我可以从一般情况和法律原则的角度，为您做一个详细的解答。
一、一般情况
公司规定：
- 许多公司为了规范管理，会设定一套离职流程，这通常包括在系统中提交离职申请、经过各级审批、完成工作交接、结算工资和福利等步骤。
- 如果您所在的公司有这样的系统，并且规定离职必须通过系统申请和审批，那么您就需要按照这一流程来操作。
协商离职的特殊性：
- 协商离职通常意味着您和公司已经就离职条件、时间等达成了一致。
- 即便如此，为了确保离职过程的规范性和可追溯性，公司可能仍然会要求您通过系统提交离职申请，以便记录离职原因、审批过程等关键信息。
二、法律原则
劳动者权益：
- 根据《劳动合同法》等相关法律法规，劳动者有权提前通知用人单位解除劳动合同，并办理离职手续。
- 用人单位不得设置不合理的离职障碍，如要求必须获得上级批准或满足特定工作条件等，否则可能涉嫌违反劳动法律。
离职流程的合理性：
- 合理的离职流程应遵循民主、透明、高效的原则，确保员工清楚知晓离职具体步骤、所需时间，并在法定时间内完成离职审批和相关手续。
- 如果公司设定的离职流程过于繁杂或存在不合理之处，您有权提出异议，并寻求法律途径维护自己的权益。
三、建议
了解公司规定：
- 首先，建议您查阅公司的员工手册或相关规章制度，了解离职流程的具体要求。
- 如果不清楚或有疑问，可以向人力资源部门或直接上级咨询。
协商与沟通：
- 如果您认为公司的离职流程存在不合理之处，可以与公司进行协商，提出您的意见和建议。
- 在协商过程中，保持冷静和理性，以达成双方都能接受的离职方案。
遵循法律原则：
- 无论公司如何规定离职流程，都应确保不违反相关法律法规，保障您的合法权益。
- 如果遇到公司设置不合理离职障碍的情况，可以寻求法律援助或向劳动监察部门投诉。
综上所述，协商离职是否需要走系统取决于您所在公司的具体规定。为了确保离职过程的顺利进行，建议您提前了解并遵循公司的离职流程，同时在必要时维护自己的合法权益。