公司和员工是否存在实质劳动关系的依据，主要可以从以下几个方面进行判断：

1. 劳动合同的签订情况：

   • 存在书面劳动合同：如果公司与员工签订了书面的劳动合同，并且合同内容明确规定了双方的权利和义务，包括工作内容、工作地点、工作时间、劳动报酬等，那么这通常是判断存在实质劳动关系的重要依据。
   • 未签订书面劳动合同：即使没有签订书面劳动合同，如果双方实际履行了劳动权利和义务，如员工提供了劳动，公司支付了劳动报酬，并且这种关系持续了一段时间，那么也可以认定为存在实质劳动关系。此时，其他证据如工资支付记录、工作证、考勤记录等将成为关键。

2. 劳动报酬的支付情况：

   • 定期支付：如果公司定期（如每月）向员工支付劳动报酬，并且支付金额与员工的工作量、工作质量等挂钩，那么这表明双方存在经济上的依附关系，是判断实质劳动关系的重要依据。
   • 支付方式：劳动报酬的支付方式（如银行转账、现金支付等）也可以作为辅助证据。特别是银行转账记录，能够清晰地显示支付方和接收方，以及支付金额和时间，对于证明劳动关系具有重要作用。

3. 工作管理和指挥情况：

   • 公司对员工的管理：如果公司对员工的工作内容、工作时间、工作地点等进行了明确的管理和指挥，并且员工需要遵守公司的规章制度和劳动纪律，那么这表明双方存在管理和被管理的关系，是判断实质劳动关系的关键。
   • 员工对公司的服从：员工是否服从公司的管理和指挥，也是判断双方是否存在劳动关系的重要因素。如果员工能够按照公司的要求完成工作任务，并且接受公司的考核和奖惩，那么这进一步证明了双方存在实质劳动关系。

4. 工作场所和工具的提供情况：

   • 公司提供工作场所和工具：如果公司为员工提供了工作场所和必要的劳动工具，如办公室、电脑、生产设备等，那么这表明公司为员工提供了劳动条件，是判断实质劳动关系的重要依据。
   • 员工自带工具：在某些特殊情况下，员工可能自带工具进行工作。但这并不排除双方存在实质劳动关系的可能性，特别是当员工的工作内容、工作时间等受到公司管理和指挥时。

5. 社会保险的缴纳情况：

   • 公司为员工缴纳社会保险：如果公司按照法律规定为员工缴纳了社会保险（如养老保险、医疗保险、失业保险等），那么这通常是判断双方存在实质劳动关系的重要依据之一。因为社会保险的缴纳需要双方建立劳动关系作为前提。

在实际操作中，判断公司和员工是否存在实质劳动关系，需要综合考虑以上多个方面的因素。如果双方对是否存在劳动关系存在争议，可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径进行解决。在劳动仲裁或诉讼过程中，双方需要提供相关证据来证明自己的主张。因此，建议公司和员工在平时就注意保留相关证据，如劳动合同、工资支付记录、工作证、考勤记录等，以便在需要时能够提供有力的证明。

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