关于法定休假日加班工资的举证责任，核心结论是：一般情况下，劳动者需就加班事实的存在承担初步举证责任；若用人单位否认加班事实，则由用人单位承担反驳证据的举证责任。以下从不同角度详细分析：
一、劳动者需承担初步举证责任
法律依据：
- 根据《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释（一）》第四十四条：“因用人单位作出的开除、除名、辞退、解除劳动合同、减少劳动报酬、计算劳动者工作年限等决定而发生的劳动争议，用人单位负举证责任。”虽然该条款未直接提及加班工资的举证责任，但结合劳动争议案件的一般举证原则，劳动者需就其主张的加班事实提供初步证据。
实践操作：
- 劳动者可以通过提供考勤记录、加班通知、工作邮件、同事证言等证据，来证明其在法定休假日进行了加班。这些证据应当能够形成完整的证据链，以支持其加班工资的主张。
二、用人单位需承担反驳证据的举证责任
法律依据：
- 在劳动争议案件中，若用人单位否认劳动者主张的加班事实，则用人单位需要提供反驳证据。这是基于“谁主张，谁举证”的一般原则，以及用人单位在劳动管理中的优势地位所决定的。
实践操作：
- 用人单位可以通过提供考勤制度、加班审批流程、员工手册等证据，来证明其未安排劳动者在法定休假日加班，或者劳动者未按照公司规定进行加班申请和审批。若用人单位无法提供充分证据反驳劳动者的加班主张，则可能承担不利后果。
三、特殊情况下的举证责任分配
不定时工作制或综合计算工时工作制：
- 在实行不定时工作制或综合计算工时工作制的用人单位中，加班工资的举证责任可能有所不同。由于这些工作制具有特殊性，劳动者可能难以直接证明其加班事实。此时，用人单位需要承担更多的举证责任，以证明其已按照相关规定支付了加班工资或未安排加班。
电子考勤记录的举证：
- 随着科技的发展，电子考勤记录在劳动争议案件中越来越常见。若用人单位采用电子考勤系统记录劳动者的工作时间，则应当确保该系统的准确性和可靠性。在劳动者对电子考勤记录提出异议时，用人单位需要提供充分的证据证明其考勤记录的真实性和完整性。
四、法律建议
对于劳动者：
- 在主张法定休假日加班工资时，务必保留好相关证据，如考勤记录、加班通知等。同时，及时向用人单位提出加班工资的主张，并保留好书面或电子形式的沟通记录。
对于用人单位：
- 建立健全的考勤制度和加班审批流程，确保劳动者的加班事实能够得到准确记录。在劳动者主张加班工资时，积极配合提供相关证据，以避免不必要的法律纠纷。
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