针对您提出的“员工不办理离职手续该如何发放工资”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、核心原则
无论员工是否办理离职手续，只要其提供了正常的劳动，用人单位均有义务按时足额支付工资。离职手续的办理，如工作交接、档案和社会保险关系转移等，是劳动者和用人单位之间的后续事宜，并不构成工资支付的前提条件。
二、具体情形分析
正常离职流程未完成：
- 若员工已提前通知用人单位并获得了离职批准，但因客观原因（如工作交接复杂、需要处理紧急事务等）在发薪日尚未完成全部离职手续，用人单位仍应按时发放工资。因为员工已经提供了劳动，用人单位不能因手续未完成而拒绝支付报酬。
自动离职情况：
- 对于员工未提前通知擅自离职的情形，用人单位在扣除因员工自动离职给单位造成的实际损失（如有证据支持）后，应支付剩余的工资。但需要注意的是，用人单位不能随意扩大损失范围或提高损失金额，必须确保扣除的金额是合理且合法的。
三、特殊情况处理
- 如果员工在离职前存在未结清的财务事项（如借款、预支款）或给公司造成了经济损失，用人单位可以在发放工资时依法扣除相应的金额。但同样需要确保扣除的金额是合理且合法的，并且最好有明确的证据支持。
- 劳动合同或公司规章制度中如有关于离职手续及工资发放的约定，且这些约定不违反法律法规的强制性规定，双方应按约定执行。但用人单位不能利用这些约定来规避支付工资的法定义务。
四、劳动者权益保护与用人单位应对措施
劳动者权益保护：
- 如果用人单位拒绝支付工资，劳动者可以通过以下途径维护自身权益：首先尝试与用人单位协商；若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉；如劳动监察部门的处理未能解决问题，可在规定的仲裁时效内向劳动争议仲裁委员会提交书面仲裁申请；若对仲裁裁决不服，可在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。
用人单位应对措施：
- 用人单位应建立健全的工资支付制度和离职管理制度，明确工资支付的时间和方式以及离职手续的办理流程。
- 在员工离职时，用人单位应积极与员工沟通，协助员工完成离职手续，并确保工资按时足额支付。
- 如果员工拒绝办理离职手续或存在其他问题，用人单位应通过合法途径解决，如向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等，而不能采取克扣工资等违法行为。
五、总结与建议
离职手续的办理与工资支付是两个独立的事项。用人单位不能以未办理离职手续为由拒绝支付劳动者已付出劳动所对应的工资。同时，劳动者也应了解自己的合法权益，并在必要时采取合法途径进行维权。对于用人单位而言，建议加强内部管理，完善相关制度，确保工资支付和离职管理的合法性和规范性。