结论：工资已结清是否包括停工留薪期工资，这主要取决于结清工资的具体内容和双方（劳动者与用人单位）的约定或相关法律法规的规定。一般情况下，如果双方没有特别约定，且法律法规也未明确排除，那么结清的工资应当包括停工留薪期工资。
分析说明：
停工留薪期工资的性质：
- 停工留薪期是劳动者因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的期间。
- 在此期间，劳动者原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付，即停工留薪期工资。
工资结清的含义：
- 工资结清通常指的是劳动者与用人单位之间就劳动报酬（包括基本工资、奖金、津贴等）的支付达成一致，且用人单位已经按照约定支付了全部应付款项。
- 如果双方在结清工资时没有特别排除停工留薪期工资，那么从常理和公平原则出发，结清的工资应当包括停工留薪期工资。
法律法规的规定：
- 根据《工伤保险条例》等相关法律法规，劳动者在停工留薪期内享有原工资福利待遇不变的待遇。
- 如果法律法规或双方合同中没有特别规定停工留薪期工资需要单独结算或排除在结清工资之外，那么用人单位在结清工资时应当一并支付停工留薪期工资。
特殊情况的处理：
- 如果双方在结清工资时有特别约定，比如明确排除了停工留薪期工资，或者用人单位能够证明已经单独支付了停工留薪期工资，那么结清的工资可能不包括停工留薪期工资。
- 另外，如果劳动者对结清工资的内容有异议，认为未包括停工留薪期工资，可以通过劳动争议调解、仲裁或诉讼等途径解决。
建议与行动：
- 对于劳动者：在结清工资时，务必仔细核对工资清单，确保停工留薪期工资等所有应得款项都已包含在内。如有疑问或异议，及时与用人单位沟通并保留相关证据。
- 对于用人单位：在结清工资时，应当明确告知劳动者工资的具体构成和支付情况，包括是否包含停工留薪期工资等。如有特殊情况或约定，应当提前与劳动者沟通并达成一致。
后续思考：如果劳动者与用人单位在停工留薪期工资的支付问题上存在争议，双方可以首先尝试通过协商或调解解决。如果协商或调解无果，劳动者可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。