党支部书记被行政拘留后，需根据具体情况从党纪、组织程序及法律后果三个层面综合处理，具体分析如下：

1. 党纪层面：需启动纪律审查程序
   根据《中国共产党纪律处分条例》第三十条，党员被行政拘留的，党组织应核实其违法事实，区分故意或过失、情节轻重，给予相应党纪处分。例如：

   • 若因赌博、嫖娼等故意违法行为被拘留，通常给予撤销党内职务或留党察看处分；
     
   • 若因过失（如交通肇事）且情节较轻，可能给予警告或严重警告处分。
     关键点：党组织需在行政拘留决定生效后30日内完成初步审查，并保障党员的陈述、申辩权。

2. 组织程序层面：可能暂停或终止职务

   • 暂停职务：根据《中国共产党支部工作条例（试行）》，党支部书记被行政拘留期间，上级党组织可暂停其职务，由副书记或委员暂代工作，确保支部正常运转。
     
   • 终止职务：若被拘留涉及严重违纪违法（如贪污、滥用职权），且可能被开除党籍或移送司法，上级党组织可按程序免去其职务，并报上级党委备案。
     示例：某村党支部书记因酒驾被拘留15日，上级党委暂停其职务，待行政处罚结束后，根据其认错态度决定是否恢复职务或给予党纪处分。

3. 法律后果层面：需区分行政拘留与刑事责任

   • 行政拘留：属于行政处罚，不涉及犯罪，但会留存违法记录，可能影响党员评优、晋升等。
     
   • 刑事责任转化：若行政拘留后发现涉嫌犯罪（如拘留期间供述其他犯罪行为），公安机关可能转为刑事拘留，此时需按《刑事诉讼法》处理，党组织应配合司法程序，并依据判决结果给予开除党籍等处分。
     提醒：党员被行政拘留后，应主动向党组织报告情况，配合调查，避免隐瞒导致处分加重。

建议行动步骤：

1. 党支部书记本人或其家属应尽快向所在党组织书面说明被拘留原因、期限及案件进展；
   
2. 党组织成立调查组，核实违法事实，听取本人陈述，形成处理建议；
   
3. 根据调查结果，按党章和纪律处分条例作出处分决定，并报上级党委审批；
   
4. 若涉及职务变动，及时调整支部工作分工，确保组织生活正常开展。
   

如有具体案件细节（如拘留原因、时长、是否涉及其他违法等），可进一步向我咨询，我会结合案例为您详细分析。