在劳务派遣制单位上班，单位要求办理的通行证费用原则上应由用人单位（即劳务派遣单位）承担，但具体还需根据实际情况和派遣协议来确定。以下是从不同角度进行的分析：
法律原则角度：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳务派遣单位作为用人单位，应当履行对劳动者的义务，包括提供必要的劳动条件。办理通行证若属于提供劳动条件的范畴，那么费用理应由劳务派遣单位承担。
派遣协议角度：
- 劳务派遣单位与用工单位（即实际使用劳动者的单位）之间会签订劳务派遣协议，明确双方的权利和义务。如果协议中明确规定了通行证费用的承担方，那么应按照协议执行。
- 若协议中未明确规定，则通常应由劳务派遣单位承担，因为这是其作为用人单位的基本义务之一。
实际情况角度：
- 在某些特殊情况下，如通行证是因用工单位的特殊需求而办理，且该需求超出了劳务派遣协议约定的范围，那么用工单位可能会与劳务派遣单位协商分担费用。
- 另外，如果劳动者因个人原因需要办理特殊通行证（如个人车辆通行证等），且该通行证并非工作必需，那么费用可能由劳动者自行承担。
建议：
- 首先，查看劳务派遣协议中是否有关于通行证费用承担的相关条款。
- 如果协议中没有明确规定，可以与劳务派遣单位和用工单位进行沟通协商，明确费用的承担方。
- 若协商无果，且认为费用应由某一方承担，可以寻求法律援助或向劳动争议调解仲裁机构申请调解仲裁。
可能后果：
- 如果费用应由劳务派遣单位承担而其拒绝支付，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
- 如果费用确实应由劳动者自行承担，而劳动者拒绝支付，可能会影响其正常工作或面临其他不利后果（如无法进入工作场所等）。因此，在办理通行证前，最好明确费用的承担方，以避免不必要的纠纷。
如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。