当员工入职不满3个月被辞退时，赔偿问题确实需要根据具体的辞退原因、劳动合同的约定以及相关法律法规来确定。以下是对此问题的详细解答：

一、试用期内的合法解除与赔偿

1. 合法解除情形：

   • 如果员工在试用期间被证明不符合录用条件，且用人单位能提供充分的证据（如考核记录、工作表现评估等）来支持这一点，同时解除程序合法（如提前通知员工、说明解除理由等），那么用人单位无需支付经济补偿金或赔偿金。

2. 违法解除情形：

   • 如果用人单位无法证明员工不符合录用条件，或者解除程序不合法（如未提前通知、未说明理由等），则构成违法解除。
   • 在此情况下，用人单位需按照《劳动合同法》第八十七条的规定，向劳动者支付赔偿金。赔偿金为经济补偿标准的二倍。由于员工工作时间不满六个月，经济补偿标准为半个月工资，因此赔偿金为一个月工资。

二、非试用期内的非法辞退与赔偿

• 如果员工虽入职不满3个月，但已过试用期（假设试用期约定合法且已届满），此时被非法辞退，用人单位需按照《劳动合同法》第四十八条和第八十七条的规定，向劳动者支付赔偿金。
• 赔偿金计算标准同样为经济补偿标准的二倍，即一个月工资（因工作时间不满六个月）。

三、其他特殊情形的处理

1. 协商一致解除：

   • 如果用人单位与员工协商一致解除劳动合同，且用人单位提出解除动议，那么用人单位需按照《劳动合同法》第三十六条和第四十六条的规定，向劳动者支付经济补偿金。
   • 经济补偿金按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。

2. 无过错性辞退：

   • 如果用人单位依据《劳动合同法》第四十条的规定，以劳动者不能胜任工作等为由解除劳动合同，也需支付经济补偿金。
   • 支付标准同上，即半个月工资的经济补偿（因工作时间不满六个月）。

3. 劳动者存在过错的情形：

   • 如果劳动者在试用期间被证明不符合录用条件，或者严重违反用人单位的规章制度，或者严重失职给用人单位造成重大损害等，用人单位可以解除劳动合同且无需支付经济补偿或赔偿金。

4. 未签订书面劳动合同：

   • 如果用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同，应当向劳动者每月支付二倍的工资。但这并不直接等同于辞退时的赔偿，而是对未签订书面劳动合同行为的惩罚性措施。若因此导致被辞退，员工可主张相应期间的双倍工资差额及可能的违法解除赔偿金（需结合具体辞退原因判断）。

四、赔偿金额的计算依据

• 月工资定义：指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。对于入职仅三个月的员工，通常以实际发放的工资为准。
• 最高限额：若劳动者月工资高于当地职工月平均工资三倍，经济补偿/赔偿金的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付年限最高不超过十二年。

综上所述，员工入职不满3个月被辞退时的赔偿问题，需要根据具体的辞退原因、劳动合同的约定以及相关法律法规来确定。希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。