在处理将建设用地使用权和建筑物分别抵押给不同债权人的情况时，确定清偿顺序是一个涉及法律原则和具体操作的关键问题。以下是根据《民法典》及相关法律规定，对此问题的详细解答：

一、清偿顺序的总体原则

1. 登记优先原则：在抵押权的设定中，已登记的抵押权具有优先于未登记抵押权的法律效力。这是保护交易安全、维护市场秩序的重要法律原则。

2. 时间先后原则：对于已经登记的抵押权，按照登记时间的先后顺序来确定清偿顺序。先登记的抵押权在清偿时具有优先权。

3. 比例分配原则：如果多个抵押权同时登记或者均未登记，那么这些抵押权将按照债权比例进行清偿。这意味着，每个债权人将根据其债权在总债权中的比例来分享抵押物的变现价款。

二、具体清偿顺序分析

1. 均已登记的情况：

   • 如果建设用地使用权和建筑物分别抵押给不同债权人，并且这两个抵押权都已经登记，那么清偿顺序将按照登记时间的先后来确定。例如，如果建设用地使用权先抵押给债权人A并登记，后来建筑物抵押给债权人B并登记，那么在清偿时，债权人A将优先于债权人B受偿。

2. 部分登记部分未登记的情况：

   • 如果其中一个抵押权已经登记，而另一个未登记，那么已登记的抵押权将优先于未登记的抵押权受偿。例如，建设用地使用权抵押给债权人A并登记，而建筑物抵押给债权人B但未登记，那么在清偿时，债权人A将优先于债权人B受偿。如果抵押物变现后仍有剩余价款，债权人B可以按比例受偿（但需注意，如果还有其他未登记的抵押权，则需按债权比例分配剩余价款）。

3. 均未登记的情况：

   • 如果建设用地使用权和建筑物分别抵押给不同债权人，并且这两个抵押权都未登记，那么清偿顺序将按照债权比例来确定。这意味着，债权人A和债权人B将根据其债权在总债权中的比例来分享抵押物的变现价款。

三、实际操作中的注意事项

1. 查看登记情况：在处理此类问题时，首先需要确认各项抵押权是否已经登记。这是确定清偿顺序的基础和前提。

2. 考虑特殊情况：在实际操作中，可能存在一些特殊情况影响清偿顺序，如法律规定、合同约定或司法裁决等。因此，在处理具体问题时，需要综合考虑这些因素。

3. 咨询专业律师：由于抵押权清偿顺序问题涉及复杂的法律关系和实际操作，建议咨询专业律师以获取准确的法律意见和指导。律师可以根据具体情况提供针对性的解决方案，确保您的合法权益得到保障。

四、结论

在确定将建设用地使用权和建筑物分别抵押给不同债权人时的清偿顺序时，应遵循“登记优先、时间先后、比例分配”的总体原则。同时，需要关注法律规定、合同约定及司法裁决等特殊因素对清偿顺序的影响。在处理具体问题时，建议咨询专业律师以确保合法权益得到保障。