在合同履行发生争议时，举证责任的分配是一个核心问题，它直接关系到当事人能否有效维护自身权益。结论前置：一般来说，合同履行发生争议主要遵循“谁主张，谁举证”的基本原则，但在特定情况下也存在举证责任倒置或转移的特殊规定。以下是对此问题的详细解答：
一、基本原则——“谁主张，谁举证”
根据《中华人民共和国民事诉讼法》第六十七条的规定：“当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。”这一原则构成了民事诉讼中举证责任分配的基础。在合同纠纷中，具体体现为：
合同订立与生效：主张合同关系成立并生效的一方，需承担证明合同订立和生效事实的举证责任。例如，提供书面合同、聊天记录、邮件往来等，以证实双方已达成合意且合同已生效。
合同关系变动：主张合同关系变更、解除、终止、撤销的一方，应对引起变动的事实承担举证责任。如提供补充协议、变更价格的沟通记录等，以证明合同关系的合法变动。
合同履行情况：对合同是否履行发生争议的，由负有履行义务的当事人承担举证责任。例如，在买卖合同中，卖方需提供发货单、物流记录、买方签收凭证等，证明其已履行交付义务；买方则需提供转账记录、收据等，证明其已支付货款。若买方主张卖方交付的货物存在质量问题，则需提供检验报告、照片等证据；卖方则可通过质量合格证书、验收记录等反驳。
二、特殊情况——举证责任倒置或转移
在某些特定情形下，法律会规定由对方当事人承担举证责任，即“举证责任倒置”。这类情形虽然不常见于一般的合同纠纷，但在某些特殊类型的合同纠纷中有所体现，例如：
专利侵权纠纷：在因新产品制造方法发明专利引发的合同纠纷中，制造同样产品的单位或个人应承担证明其产品制造方法不同于专利方法的举证责任。
劳动争议纠纷：在劳动争议案件中，如因用人单位作出开除、除名、辞退、解除劳动合同、减少劳动报酬、计算劳动者工作年限等决定而引发争议，由用人单位承担举证责任。用人单位需提供证据证明其决定的合法性及合理性，如员工违反规章制度的证据、规章制度的制定与实施情况等。
三、实际操作建议
积极收集证据：无论是原告还是被告，在合同纠纷中都应积极收集并整理相关证据，以确保自己的主张得到支持。证据的形式可以多样，包括书面文件、电子数据、证人证言等。
了解法律规定：当事人应充分了解举证责任的相关法律规定，以便在案件中合理运用，维护自身权益。特别是要关注那些可能导致举证责任倒置或转移的特殊规定。
注意证据的时效性和完整性：在收集证据时，要注意证据的时效性和完整性。例如，物流记录、转账记录等应保留完整的时间链和交易细节；证人证言应尽可能详细、具体，并附上证人的联系方式以便法院核实。
及时寻求法律帮助：在处理复杂的合同纠纷时，如果感到困惑或不确定如何收集证据、如何运用举证责任规则等，可以及时向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见和帮助。
综上所述，合同履行发生争议时的举证责任分配既遵循一般原则，又在特定情况下存在特殊规定。当事人应根据具体情况合理运用这些规则，以确保案件的公正审理和自身权益的有效保护。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。