结论：在合同纠纷中，当对合同是否履行发生争议时，一般遵循“谁主张，谁举证”的原则，但特定情况下由负有履行义务的当事人承担举证责任。这一规定旨在确保公平，并基于充分的证据解决纠纷。
一、举证责任分配的基本原则
“谁主张，谁举证”原则：
- 这是民事诉讼中举证责任分配的基本原则。在合同纠纷中，若一方主张合同已经履行，那么该方需提供证据来证明其已经按照合同约定履行了相应的义务。例如，在买卖合同中，如果卖方主张已经按时、足额交付了货物，那么卖方需要提供交货凭证、物流单据、买方签收记录等证据来支持其主张。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》第六十七条：“当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。”这一规定构成了民事诉讼中举证责任分配的基础。
二、特定情形下的举证责任倒置
合同履行争议中的举证责任倒置：
- 在合同履行争议中，为体现公平原则，通常由负有履行义务的当事人承担举证责任，证明其已按合同约定履行了义务。例如，在买卖合同中，如果双方对货物是否交付产生直接争议，卖方作为负有交付义务的一方，应承担主要举证责任，证明其已按合同约定完成了交付。
其他特定情形：
- 除了合同履行争议外，还有一些特定情形下也会发生举证责任倒置。例如，在专利侵权纠纷中，被控侵权人需证明其使用的技术属于现有技术或合法来源；在医疗损害责任纠纷中（需注意，《民法典》已调整为一般过错责任），医疗机构需证明诊疗行为无过错及与损害结果无因果关系。不过，这些特定情形在合同纠纷中并不常见。
三、举证责任的具体操作与法律后果
合法有效的证据：
- 负有履行义务的当事人应提供书面证据（如交付单据、收据、质量检验报告等）、证人证言、视听资料等，以证明其履行合同的情况。这些证据应当合法、有效，并能够形成完整的证据链。
证据不足的法律后果：
- 若负有履行义务的当事人未能及时举证或提供的证据不足以证明其履行情况，可能会被视为未履行或违约，并承担相应的法律责任。例如，在买卖合同中，如果卖方无法提供有效的交货凭证，买方有权拒绝支付货款，并可能要求卖方承担违约责任。
四、实际案例与法院判断
买卖合同案例：
- 假设在一个买卖合同中，买方主张卖方未交付货物，而卖方则主张已经交付。在此情况下，根据法律规定，卖方作为负有交付义务的一方，应承担主要举证责任。如果卖方能够提供有效的交货凭证和买方签收记录等证据，那么法院可能会认定卖方已经履行了交付义务；反之，如果卖方无法提供这些证据，那么法院可能会认定卖方未履行交付义务。
法院的综合判断：
- 法院在处理合同纠纷时，会综合考虑案件的具体情况、证据的证明力以及公平原则等因素，来判断举证责任的承担和案件的最终结果。因此，当事人在提供证据时，应尽可能提供全面、客观、真实的证据，以支持自己的主张。
五、建议与注意事项
保留好相关证据：
- 在合同履行过程中，当事人应妥善保管好与合同履行相关的所有证据，包括书面证据、证人证言、视听资料等。这些证据在发生争议时将成为证明自己主张的关键。
及时举证：
- 在诉讼过程中，当事人应按照法院的要求及时举证，避免因逾期举证而承担不利的法律后果。
寻求专业帮助：
- 鉴于合同纠纷的复杂性和多样性，当事人在面临此类问题时可以向我咨询，我会根据具体情况提供针对性的法律建议和帮助。
总之，在合同纠纷中，当对合同是否履行发生争议时，举证责任的分配是一个核心问题。当事人应了解并遵循相关的法律规定和原则，积极收集并保留好相关证据，以维护自己的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。