乡政府将耕地非法改变用途的行为，主要归县级以上人民政府土地行政主管部门（通常是自然资源局）管辖，同时可能涉及农业农村部门、纪检监察机关以及司法机关的监督与处理。以下从不同角度为您详细分析：

一、主要监管部门：县级以上人民政府土地行政主管部门

根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，县级以上人民政府土地行政主管部门负责本行政区域内土地的管理和监督工作。这包括了对土地用途的管制，即确保土地按照规划确定的用途使用，禁止擅自改变土地用途。因此，当乡政府将耕地非法改变用途时，县级以上人民政府土地行政主管部门有权进行查处，并可以责令限期改正、没收违法所得、罚款等。

二、可能涉及的其他部门

1. 农业农村部门：

   • 农业农村部门在耕地保护方面也扮演着重要角色。他们负责指导粮食等农产品生产，以及耕地及永久基本农田的质量保护。如果乡政府非法改变耕地用途涉及到了农业生产或耕地质量的问题，农业农村部门也可能会介入调查和处理。

2. 纪检监察机关：

   • 如果乡政府非法改变耕地用途的行为涉及到了公职人员的违纪违法行为，如滥用职权、玩忽职守等，纪检监察机关将会依法进行查处。他们负责监督公职人员的行为，确保他们依法履职、廉洁从政。

3. 司法机关：

   • 在极端情况下，如果乡政府非法改变耕地用途的行为构成了犯罪，如非法占用农用地罪等，司法机关将会依法追究相关责任人的刑事责任。这包括公安机关的立案侦查、检察机关的提起公诉以及法院的审判等环节。

三、具体处理流程

1. 发现与举报：

   • 任何单位和个人都有权对非法改变耕地用途的行为进行举报。一旦发现乡政府存在此类行为，可以向县级以上人民政府土地行政主管部门或其他相关部门进行举报。

2. 调查与处理：

   • 相关部门在接到举报后，将会依法进行调查。如果查实乡政府确实存在非法改变耕地用途的行为，将会依法进行处理，包括责令限期改正、没收违法所得、罚款等。同时，如果涉及到了公职人员的违纪违法行为或犯罪行为，将会依法移送纪检监察机关或司法机关进行处理。

3. 监督与复查：

   • 相关部门在处理完非法改变耕地用途的行为后，还会进行监督和复查，确保土地用途得到恢复或符合规划要求。

四、法律后果

乡政府非法改变耕地用途的行为，不仅可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等，还可能涉及刑事责任。如果行为构成了犯罪，相关责任人将会被依法追究刑事责任。此外，该行为还可能对当地的农业生产、生态环境等造成严重影响，引发社会关注和舆论谴责。

温馨提示：如果您发现了乡政府非法改变耕地用途的行为，建议及时向相关部门进行举报，并保留好相关证据以便后续处理。同时，如果您在处理此类问题时遇到任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。