劳动合同约定税后工资是合法的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与合法性基础
《中华人民共和国劳动法》：该法规定劳动合同应当明确劳动报酬，且劳动报酬的支付方式可以由用人单位和劳动者协商确定。这意味着，双方有权在劳动合同中约定税前工资或税后工资的形式。
《中华人民共和国个人所得税法》：该法并未禁止用人单位与劳动者在劳动合同中约定税后工资。实际上，税后工资的约定是双方对劳动报酬支付方式的一种具体安排，不违反税收法律法规的强制性规定。
二、合法性分析
意思自治原则：
- 劳动合同作为民事合同的一种，遵循意思自治的原则。只要双方在平等自愿的基础上达成一致，且不违反法律法规的强制性规定，合同内容即为有效。
- 因此，用人单位与劳动者可以在劳动合同中明确约定支付税后工资，这是双方真实意思的表示，具有法律效力。
实际履行情况：
- 在实际操作中，许多企业为了吸引人才或出于其他考虑，会与员工约定税后工资。这种约定并不违法，且在实际履行中也得到了广泛认可。
- 税后工资的约定有助于明确劳动者的实际收入，减少因税收问题产生的纠纷。
税务处理：
- 当用人单位与员工约定税后工资时，用人单位需要承担代扣代缴个人所得税的义务。这意味着用人单位在发放工资前，需要先计算出应缴纳的个人所得税额，并从应发工资中扣除该部分税款后，再将剩余金额支付给员工。
- 这种处理方式虽然增加了用人单位的财务成本和管理难度，但并不影响合同的合法性。用人单位应确保按照税收法规的规定进行操作，避免出现税务风险。
三、注意事项与建议
明确约定：
- 为了避免后续产生纠纷，建议在劳动合同中明确约定税后工资的具体数额或计算方式。这样有助于双方对劳动报酬有清晰的预期和了解。
合规操作：
- 用人单位在履行代扣代缴义务时，应确保按照税收法规的规定进行操作。这包括准确计算应缴纳的个人所得税额、及时缴纳税款等。
- 劳动者也有权了解自己的税收情况，并要求用人单位提供相关的税务证明和资料。
保留证据：
- 用人单位和劳动者都应妥善保管好相关证据材料，如劳动合同、工资条、银行转账记录等。这些证据材料在后续可能发生的纠纷中具有重要的证明作用。
法律咨询：
- 如果在劳动合同签订或履行过程中遇到任何法律问题或疑问，建议及时咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和帮助。
综上所述，劳动合同约定税后工资是合法的，但双方应明确约定、合规操作并保留好相关证据材料。如有任何法律问题或疑问，请随时向我咨询。