行政机关的询问笔录上被询问人写了两个名字，这份询问笔录并不一定无效，其有效性需根据具体情况来判断。以下是从多个角度对这一问题的详细分析：
一、询问笔录的形式要件
签名或盖章的真实性：
- 询问笔录应由被询问人签名或盖章确认，这是笔录形式要件的重要组成部分。如果被询问人写了两个名字，但这两个名字都是其真实姓名，且能够确认是其本人所写，那么从形式上看，笔录仍然具有合法性。
- 如果其中一个名字是假名或别名，且无法确认是被询问人本人所写，或者被询问人否认其中一个名字是其所签，那么这部分笔录可能因形式要件不合法而无效。
笔录的完整性和清晰度：
- 询问笔录应纸张、字迹清晰可辨，避免出现模糊、涂改等情况。如果被询问人写了两个名字导致笔录出现模糊或涂改，且无法确认其真实性，那么这部分笔录可能因不完整或不清晰而影响其有效性。
二、询问笔录的内容真实性
陈述和申辩的真实性：
- 询问笔录应如实记录被询问人的陈述和申辩，不得歪曲或篡改。如果被询问人写了两个名字，但笔录内容真实反映了其陈述和申辩，且没有其他证据表明笔录内容被歪曲或篡改，那么笔录仍然具有真实性。
- 如果被询问人因写两个名字而引发对笔录内容的质疑，且无法证明笔录内容的真实性，那么这部分笔录可能因内容不真实而无效。
修改或补充的确认：
- 如果被询问人在笔录上有修改或补充，应由其在修改处捺指印或签字确认。如果被询问人写了两个名字，但无法确认其对修改或补充部分的确认，那么这部分笔录可能因缺乏确认而影响其真实性。
三、询问笔录的程序合法性
制作主体的合法性：
- 询问笔录必须由具有行政执法资格的执法人员制作。如果制作笔录的执法人员具备合法资格，且遵循了法定程序，那么即使被询问人写了两个名字，也不影响笔录的程序合法性。
询问过程的合法性：
- 询问过程中应保障被询问人的合法权益，如陈述权、申辩权等。如果被询问人因写两个名字而引发对询问过程合法性的质疑，且无法证明询问过程合法，那么这部分笔录可能因程序不合法而无效。
四、提高询问笔录有效性的建议
确保签名或盖章的真实性：
- 执法人员在制作询问笔录时，应要求被询问人使用其真实姓名签名或盖章，并确认其身份。如果被询问人写了两个名字，执法人员应核实其真实性，并要求被询问人确认哪个名字是其真实姓名。
保障询问过程的合法性：
- 执法人员在询问过程中应遵循法定程序，保障被询问人的合法权益。如果被询问人对询问过程有异议或质疑，执法人员应及时记录并处理。
注重笔录的完整性和清晰度：
- 执法人员在制作询问笔录时，应确保笔录内容完整、清晰可辨。如果被询问人写了两个名字导致笔录出现模糊或涂改，执法人员应及时进行修正或补充，并要求被询问人确认。
总结来说，行政机关的询问笔录上被询问人写了两个名字，并不直接导致笔录无效。其有效性需根据签名或盖章的真实性、笔录内容的真实性、询问过程的合法性以及笔录的完整性和清晰度等多个方面来判断。如果您对询问笔录的有效性有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。