公司破产案件是可以由仲裁机构受理的，但具体情形需根据案件性质和仲裁协议来确定。
一、法律依据与合法性
《中华人民共和国企业破产法》的相关规定：
- 根据该法，人民法院受理破产申请后，已经开始而尚未终结的有关债务人的民事诉讼或者仲裁应当中止；待管理人接管债务人的财产后，该诉讼或者仲裁则继续进行。这一规定确保了仲裁程序的连贯性和有效性，不因破产程序的启动而中断。
《中华人民共和国仲裁法》的适用：
- 仲裁法并未排除破产案件中的仲裁适用。只要双方当事人之间存在有效的仲裁协议，且争议属于仲裁协议约定的范围，仲裁机构就有权受理并裁决。
二、不同情形下的仲裁受理
债权人与破产企业的仲裁：
- 如果债权人和破产企业之间事先签订了有效的仲裁协议，涉及该协议范围内的争议时，债权人可以按照仲裁程序向仲裁机构申请仲裁。
- 仲裁裁决的执行需遵循破产程序的统一安排，纳入破产财产的整体分配框架中，不能个别优先执行。
- 债权人在申请仲裁的同时，也需要在人民法院确定的债权申报期限内向管理人申报债权，以确保其在破产程序中的受偿权益。
劳动者与公司的劳动仲裁：
- 公司破产清算并不影响其法人主体资格的存在，在法人注销之前，公司仍需承担相应的法律责任，包括员工工资、经济补偿等。
- 如果劳动者和公司之间因劳动关系产生纠纷，如工资支付、经济补偿等，劳动者可以向劳动仲裁委员会提起劳动仲裁，要求公司承担相应的法律责任。
- 劳动者的仲裁请求可能需要与公司的破产清算程序相协调，以确保劳动者的权益得到合理保障。例如，劳动者的债权可能属于优先清偿范畴，在破产财产分配中应得到优先处理。
三、仲裁程序与破产程序的协调
- 仲裁程序的中止与继续：在破产程序启动后，尚未终结的仲裁程序应当中止，待管理人接管债务人财产后继续进行。这确保了仲裁程序与破产程序的顺利衔接。
- 仲裁裁决的执行：仲裁裁决作出后，其执行需遵循破产程序的统一安排。如果破产财产不足以清偿所有债务，仲裁裁决确定的债权将按照破产法的规定进行分配。
- 及时沟通与协调：在仲裁过程中，当事人应及时与破产管理人沟通，了解破产程序的进展情况，确保仲裁程序与破产程序的有效协调。
四、注意事项与建议
- 及时申报债权：对于债权人而言，及时申报债权是确保其在破产程序中受偿权益的重要步骤。即使已申请仲裁，也应在规定期限内完成债权申报。
- 保留相关证据：在申请仲裁前，当事人应保留好与争议相关的所有证据，如合同、发票、付款记录等，以便在仲裁过程中证明自己的主张。
- 关注破产进展：当事人应及时关注破产案件的进展情况，配合破产管理人工作，确保仲裁与破产程序的有效衔接。
综上所述，公司破产案件是可以由仲裁机构受理的，但具体情形需根据案件性质和仲裁协议来确定。在实际操作过程中，建议当事人根据具体情况咨询我，以获取更具体的法律建议和帮助。