结论：公司以26天为满勤，员工实际工作28天，公司却因未工作的2天扣钱，这种做法是否合适，需分情况讨论。
分析：
劳动合同或公司规章制度有明确规定：
- 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了满勤天数以及超出满勤天数的工资计算方式，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照这一规定执行是合法的。但在此情况下，若员工实际工作天数超过了满勤天数，公司应当按照约定支付相应的加班工资或额外报酬，而不是扣钱。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条，有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：…（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。虽然此条直接针对的是法定休假日，但原理上，超出正常工作时间的劳动都应得到相应补偿。同时，根据《中华人民共和国劳动合同法》第三条，订立劳动合同，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。这意味着劳动合同中的条款，包括工资和工作时间，都应当是公平合理的。
劳动合同或公司规章制度无明确规定：
- 如果劳动合同或公司规章制度中没有明确规定满勤天数以及超出满勤天数的工资计算方式，那么公司因员工未工作的2天（在员工已实际工作28天的情况下）而扣钱，可能缺乏合法依据。员工有权要求公司按照其实际工作天数支付工资，并可能就公司的不当扣款行为提出异议或投诉。
- 法律建议：在此情况下，员工可以先与公司进行协商，要求公司按照其实际工作天数支付工资。如果协商无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
特殊情况考虑：
- 如果员工未工作的2天是由于公司原因（如停工、放假等）导致的，那么公司扣钱显然是不合理的。员工有权要求公司支付这2天的工资，或者按照公司规定进行调休。
- 如果员工未工作的2天是由于员工个人原因（如请假、旷工等）导致的，且公司规章制度中有明确规定这种情况下如何扣款，那么公司按照规章制度执行是合法的。但即便如此，如果员工已实际工作超过满勤天数，公司也应当支付相应的加班工资或额外报酬。
总结与建议：
- 公司以26天为满勤，员工实际工作28天，公司却因未工作的2天扣钱，这种做法是否合适，取决于劳动合同或公司规章制度中的具体规定。
- 如果规定不明确或存在争议，员工有权要求公司按照其实际工作天数支付工资，并可能就公司的不当扣款行为提出异议或投诉。
- 在任何情况下，公司都应当遵守法律法规的强制性规定，确保员工的合法权益得到保障。如果员工遇到类似问题，建议先与公司进行协商，协商无果后再考虑向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
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