结论：员工在非吸烟区吸烟，公司应给予的惩罚需依据公司规章制度、劳动合同以及相关法律法规来确定，常见的惩罚措施包括警告、罚款、解除劳动合同等，但具体惩罚需合法合理且符合公司规定。
分析说明：
公司规章制度：
- 公司通常会在其规章制度中明确规定员工在非吸烟区吸烟的处罚措施。这些规定可能包括警告、罚款、扣减奖金、降职降薪，甚至在严重情况下解除劳动合同等。
- 关键点：公司规章制度需经过民主程序制定，且已向员工公示或告知，否则可能无法作为处罚依据。
劳动合同：
- 劳动合同中也可能包含关于员工违反公司规定（包括在非吸烟区吸烟）的处罚条款。
- 关键点：劳动合同中的处罚条款需合法合理，且不得违反法律法规的强制性规定。
相关法律法规：
- 在处理员工违纪行为时，公司需遵守《劳动法》、《劳动合同法》等相关法律法规的规定。
- 警告与罚款：对于轻微违纪行为，公司可以给予警告或罚款等处罚，但罚款金额需合理，且不得超过法定限额（如根据《工资支付暂行规定》，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付）。
- 解除劳动合同：对于严重违纪行为，如多次在非吸烟区吸烟且拒不改正，或因此造成严重后果的，公司可以依据《劳动合同法》的规定解除劳动合同，但需确保解除行为合法合理，且已履行必要的程序（如提前通知工会、告知员工解除理由等）。
特殊场景：
- 若公司规章制度或劳动合同中未明确规定在非吸烟区吸烟的处罚措施，公司应依据相关法律法规和公平合理原则进行处理，避免随意处罚或过度处罚。
- 若员工对公司的处罚决定不服，可以依法申请劳动仲裁或提起诉讼，维护自己的合法权益。
行动建议：
- 公司角度：建议公司完善规章制度，明确规定员工在非吸烟区吸烟的处罚措施，并确保这些规定合法合理且已向员工公示或告知。同时，在处理员工违纪行为时，应依法依规进行，避免引发劳动争议。
- 员工角度：建议员工遵守公司规章制度和法律法规的规定，不要在非吸烟区吸烟。若对公司处罚决定有异议，可以依法维护自己的合法权益。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。