利用公司资源谋取个人利益超过5千元，属于违法行为，可能涉及职务侵占罪或非国家工作人员受贿罪等，具体处理方式需根据实际情况判断。以下是详细分析：
法律定性：
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，构成职务侵占罪。这里的“数额较大”通常指6万元以上，但不同地区可能根据经济状况有所调整。不过，即使未达到刑事立案标准，该行为也违反了《中华人民共和国公司法》和公司内部规章制度，公司有权要求返还财产、赔偿损失，并可能解除劳动合同。
- 如果行为涉及收受他人财物为他人谋取利益，且数额较大，则可能构成非国家工作人员受贿罪。
处理方式：
- 公司内部处理：公司一旦发现此类行为，应立即启动内部调查程序，收集证据，如财务记录、监控录像、证人证言等。根据调查结果，公司可以依据内部规章制度对涉事员工进行纪律处分，包括警告、罚款、降职、解雇等，并要求其返还非法所得、赔偿损失。
- 刑事报案：如果行为涉嫌犯罪，且达到刑事立案标准，公司应向公安机关报案，由公安机关立案侦查。在侦查过程中，公司应积极配合，提供必要的证据和协助。
- 民事诉讼：除了刑事报案外，公司还可以选择向法院提起民事诉讼，要求涉事员工返还非法所得、赔偿损失。这种方式相对灵活，不受刑事立案标准的限制，但需要公司自行承担诉讼费用和风险。
预防措施：
- 完善内部制度：公司应建立健全的财务管理制度和内部控制机制，明确员工职责和权限，防止员工利用职务之便谋取私利。
- 加强培训教育：定期对员工进行法律知识和职业道德培训，提高员工的法律意识和职业道德水平，增强员工的自律能力。
- 建立监督机制：设立内部审计部门或聘请外部审计机构对公司财务进行定期审计，及时发现和纠正问题。同时，鼓励员工举报违法行为，对举报人给予保护和奖励。
建议：如果您或您的公司遇到此类问题，建议立即收集证据并咨询专业律师（即我），以便根据具体情况制定合适的处理方案。同时，加强内部管理和监督，预防类似问题的再次发生。