代理同事跟本单位打官司，并不必然导致被辞退，但存在被辞退的风险，具体取决于多种因素。以下从不同角度为你详细分析：
一、法律层面分析
劳动者权益保护：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者享有平等就业和选择职业的权利、取得劳动报酬的权利、休息休假的权利、获得劳动安全卫生保护的权利、接受职业技能培训的权利、享受社会保险和福利的权利、提请劳动争议处理的权利以及法律规定的其他劳动权利。
- 代理同事参与劳动仲裁或诉讼，是行使提请劳动争议处理权利的一种表现，法律并未禁止劳动者在劳动争议中委托他人代理，包括委托同事代理。
用人单位辞退的合法性：
- 用人单位辞退劳动者必须基于合法理由，如劳动者严重违反用人单位的规章制度、严重失职或营私舞弊给用人单位造成重大损害、劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系对完成本单位的工作任务造成严重影响或经用人单位提出拒不改正等。
- 单纯因为劳动者代理同事参与劳动仲裁或诉讼，并不构成用人单位合法辞退的理由。
二、实际情况分析
用人单位的态度：
- 不同用人单位对劳动者代理同事参与劳动仲裁或诉讼的态度可能不同。有些用人单位可能对此持开放态度，认为这是劳动者行使合法权利的表现；而有些用人单位则可能对此持反对态度，认为这影响了单位内部的和谐稳定或损害了单位的利益。
代理行为的影响：
- 如果代理行为确实对用人单位的正常运营或利益造成了实质性损害，如泄露了单位商业秘密、干扰了单位正常工作秩序等，那么用人单位可能会以此为由辞退劳动者。
- 但如果代理行为并未对用人单位造成实质性损害，或者损害程度较轻，那么用人单位辞退劳动者的合法性就可能受到质疑。
三、建议与措施
了解用人单位规章制度：
- 在代理同事参与劳动仲裁或诉讼前，建议先了解用人单位的相关规章制度，特别是关于员工行为规范、劳动争议处理等方面的规定。
谨慎行事，避免损害单位利益：
- 在代理过程中，应谨慎行事，避免泄露单位商业秘密、干扰单位正常工作秩序等行为，以免给用人单位造成实质性损害。
保留证据，维护自身权益：
- 如果用人单位因此事辞退你，应保留好相关证据，如辞退通知、代理过程中的相关文件等，以便在后续的劳动争议处理中维护自身权益。
寻求法律援助：
- 如果对用人单位的辞退决定有异议，可以及时向我咨询或寻求其他法律援助，了解自身权益和维权途径。
总结来说，代理同事跟本单位打官司并不必然导致被辞退，但确实存在被辞退的风险。为了降低这种风险，建议你在代理前了解用人单位的规章制度，谨慎行事避免损害单位利益，并保留好相关证据以维护自身权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。