结论：单位因员工未考过要求的证书而扣工资，这一行为是否合法，需根据具体情况来判断，一般情况下是不合法的。以下从不同角度进行分析：

一、从劳动合同的角度分析

根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。劳动合同中应当明确约定劳动报酬、工作内容、工作地点等关键条款。如果劳动合同中没有明确约定员工必须考取特定证书，且未考取证书将作为扣减工资的条件，那么单位单方面因员工未考过证书而扣工资，就缺乏合同依据，属于违法行为。

举例：假设小张与单位签订的劳动合同中，并未提及需要考取某证书，也未约定未考取将扣减工资。那么，单位因小张未考过该证书而扣其工资，就违反了劳动合同的约定，小张有权要求单位补发被扣的工资。

二、从规章制度的角度分析

即使劳动合同中没有明确约定，单位也可能通过内部规章制度来规定员工必须考取特定证书，并设定相应的奖惩措施。然而，根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条的规定，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。并且，这些规章制度应当公示或者告知劳动者。

如果单位未按照上述程序制定规章制度，或者规章制度中未明确规定未考取证书将扣减工资，那么单位因员工未考过证书而扣工资的行为，仍然是不合法的。

举例：假设单位制定了一项规章制度，规定员工必须考取某证书，否则将扣减工资。但这项规章制度并未经过职工代表大会讨论，也未公示或告知员工。那么，这项规章制度对员工就不具有约束力，单位因此扣减员工工资的行为就是违法的。

三、从法律原则的角度分析

劳动法的基本原则之一是保护劳动者的合法权益。单位因员工未考过证书而扣工资，实际上是对员工劳动报酬的侵犯，违背了劳动法保护劳动者合法权益的原则。除非有明确的法律依据或合同约定，否则单位不得随意扣减员工的工资。

法律建议

1. 审查劳动合同和规章制度：员工应首先审查自己的劳动合同和单位的规章制度，看是否有关于考取证书和扣减工资的相关约定或规定。
2. 与单位协商：如果发现单位的行为违法或违反合同约定，员工可以与单位进行协商，要求单位补发被扣的工资。
3. 寻求法律援助：如果协商无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。

总结：单位因员工未考过要求的证书而扣工资，这一行为在一般情况下是不合法的。员工应审查自己的劳动合同和单位的规章制度，与单位进行协商，并在必要时寻求法律援助来维护自己的合法权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。