若涤除分公司负责人后，被告公司不履行相关义务，你可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 明确不履行的具体内容：

   • 首先，需要明确被告公司不履行的具体是什么义务。是未办理分公司负责人的变更登记手续，还是未支付你应得的报酬或补偿，亦或是其他与涤除分公司负责人相关的义务。明确这一点后，才能有针对性地采取措施。

2. 发送律师函或催告函：

   • 在明确被告公司不履行的义务后，你可以委托律师向被告公司发送律师函或催告函，正式要求其履行相关义务。律师函或催告函通常具有法律上的威慑力，能够促使被告公司重视并尽快履行义务。

3. 提起诉讼或申请仲裁：

   • 如果被告公司收到律师函或催告函后仍不履行义务，你可以考虑向法院提起诉讼或根据合同中的仲裁条款申请仲裁。在诉讼或仲裁过程中，你需要提供充分的证据证明被告公司的不履行行为，以及你因此遭受的损失。
   • 诉讼流程：包括准备起诉状、证据材料，向法院提交并缴纳诉讼费，等待法院立案、开庭审理，最终等待判决。如果判决支持你的诉讼请求，被告公司仍不履行，你还可以申请强制执行。
   • 仲裁流程：如果合同中有仲裁条款，你需要向约定的仲裁机构提交仲裁申请，并按照仲裁规则进行仲裁程序。仲裁裁决具有与法院判决同等的法律效力，如果被告公司不履行仲裁裁决，你也可以申请强制执行。

4. 申请强制执行：

   • 如果法院判决或仲裁裁决支持你的诉讼请求，但被告公司仍不履行义务，你可以向法院申请强制执行。法院会采取一系列措施来强制被告公司履行义务，如查封、扣押、拍卖被告公司的财产等。

5. 考虑其他法律手段：

   • 除了上述措施外，你还可以考虑向相关部门投诉或举报被告公司的违法行为，如向工商行政管理部门投诉其未办理变更登记手续等。这些行为虽然可能不直接解决你的问题，但可以对被告公司形成一定的压力，促使其尽快履行义务。

在采取上述措施时，你需要注意以下几点：

• 保留证据：在整个过程中，你需要保留好所有与涤除分公司负责人、被告公司不履行义务相关的证据，如合同、律师函、催告函、法院判决或仲裁裁决等。这些证据将是你维护自己合法权益的重要依据。
• 及时行动：一旦发现被告公司不履行义务，你应该及时采取行动，避免错过诉讼时效或仲裁时效等法律期限。
• 寻求专业帮助：如果你对法律程序不熟悉或感到困惑，可以寻求专业律师的帮助。律师能够为你提供专业的法律意见和指导，帮助你更好地维护自己的合法权益。

最后，我想强调的是，法律程序可能相对复杂且耗时较长，但只要你坚持并采取正确的措施，你的合法权益最终将得到保护。如果你在这个过程中有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。