确认违建的司法程序主要涉及行政诉讼和民事诉讼中的司法审查，法院不会直接认定违建，而是依据行政机关的决定、相关法律规定及案件具体情况进行综合判断和裁判。以下从不同角度为您详细解析：
一、行政诉讼中的司法审查
规划许可纠纷：
- 当涉及规划许可争议时，比如有人认为某建筑违反了规划要求，可以向法院提起行政诉讼。
- 法院在审理此类案件时，会对相关建筑是否符合规划要求进行审查，包括审查行政机关在颁发规划许可时是否遵循了法定程序，以及建筑本身是否符合规划许可的具体要求。
行政处罚争议：
- 如果行政机关对涉嫌违章建筑作出了行政处罚决定，比如罚款、拆除等，相对人不服的可以向法院提起行政诉讼。
- 法院在审理此类案件时，会对该建筑是否属于违章建筑进行实质性审查，包括审查行政机关在认定违建过程中是否遵循了法定程序，以及涉及违建的事实是否符合规划许可、土地使用等相关规定。
二、民事纠纷中的关联认定
物权纠纷：
- 在物权纠纷中，如果违章建筑的认定与物权的归属、使用等存在关联，比如有人主张对某违章建筑拥有所有权或使用权，而另一方则否认。
- 法院在审理此类案件时，可能会对违章建筑的性质进行认定，以判断物权的归属和使用情况。但这种认定通常是基于行政机关的决定或相关法律规定进行的。
合同纠纷：
- 涉及以违章建筑为标的的合同纠纷时，比如有人签订了购买或租赁违章建筑的合同，后来因为合同无效或无法履行而产生纠纷。
- 法院在审理此类案件时，也需要对违章建筑进行确认，以判断合同的有效性和履行情况。这种确认同样会基于行政机关的决定或相关法律规定进行。
三、法院的执行权与特殊情况考量
执行权：
- 虽然法院无权直接认定违建，但当行政机关作出处理决定并向法院申请强制执行时，比如要求拆除违章建筑，法院有权对违建进行强制执行。
- 在执行过程中，法院会确保执行行为的合法性和合理性，保护当事人的合法权益。
特殊情况考量：
- 在实际操作中，法院会考虑一些特殊情况，比如历史遗留问题中的早期建设建筑。这些建筑可能因为历史原因而缺乏完整的规划许可或建设手续，但并不一定构成违章建筑。
- 法院在审理涉及此类建筑的案件时，会根据具体情况进行综合考量和认定，确保法律的正确实施和公共利益的维护。
四、法律建议
- 如果您认为某建筑是违章建筑，并希望得到法院的确认或处理，建议首先向具有相应职权的行政机关（如城乡规划主管部门或乡镇人民政府）进行举报或申请认定。
- 如果对行政机关的决定不服，可以向法院提起行政诉讼，由法院进行司法审查。
- 在涉及物权或合同纠纷时，如果违章建筑的认定与纠纷解决存在关联，可以在诉讼中提出相关请求，由法院进行综合判断和裁判。
希望以上解答能够帮助您更好地理解确认违建的司法程序。如果您有任何其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。